RNA–Protein interactions for RNA: YHR184W

SSP1, Transcript of Protein involved in the control of meiotic nuclear division, yeast

Gene SSP1, Length 1,716 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP1	YHR184W	CBF2	P32504	956 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MUP3	P38734	546 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YEL068C	P39977	110 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YGR079W	P53249	370 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	REG1	Q00816	1014 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	WAR1	Q03631	944 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YML053C	Q04978	212 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PCL8	Q08966	492 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ENT1	Q12518	454 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SAN1	P22470	610 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SIP1	P32578	815 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TDP1	P38319	544 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PSD1	P39006	500 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YFL015C	P43578	164 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ASE1	P50275	885 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	COX1	P00401	534 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YML003W	P0CF16	290 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	AAC3	P18238	307 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ERG8	P24521	451 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	GEX2	P36173	615 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	LAS21	P40367	830 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	COG2	P53271	262 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RAD33	Q04231	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ARG7	Q04728	441 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	GTB1	Q04924	702 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	IRC10	Q08118	586 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SWT1	Q12104	458 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
SSP1	YHR184W	LCB4	Q12246	624 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SPO16	P17122	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MRP20	P32387	263 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PAH1	P32567	862 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ERC1	P38767	581 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YJR061W	P40355	935 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	LYS14	P40971	790 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	NPA3	P47122	385 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SUT2	Q12286	268 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	CDC16	P09798	840 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PMA2	P19657	947 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	AAD3	P25612	363 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YMC1	P32331	307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YEL020C	P39994	560 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	FMP10	P40098	244 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	BSC5	P53755	489 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PLM2	Q04383	521 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ATG23	Q06671	453 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	NBP2	Q12163	236 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	VCX1	Q99385	411 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RPN13	O13563	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	IMP2'	P32351	346 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	HES1	P35843	434 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YIL166C	P40445	542 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SIP4	P46954	829 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	UBX6	P47049	396 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	VPS4	P52917	437 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RCO1	Q04779	684 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	HRD3	Q05787	833 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PSK2	Q08217	1101 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ULA1	Q12059	462 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	NUS1	Q12063	375 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MED1	Q12321	566 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	SKM1	Q12469	655 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	LAC1	P28496	418 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	EXO1	P39875	702 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	DJP1	P40564	432 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	OPT1	P40897	799 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	STU2	P46675	888 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	AAT1	Q01802	451 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP1	YHR184W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92

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