RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	IZH4	Q99393	312 aa		5	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	COX6	P00427	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	COR1	P07256	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GAL2	P13181	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
RPL28	YGL103W	PER1	P25625	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	NDI1	P32340	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RPC82	P32349	654 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	DPH2	P32461	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	AEP1	P32493	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	HSP78	P33416	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PEX6	P33760	1030 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PTH2	P34222	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PTC1	P35182	281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	HSL7	P38274	827 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	LYS9	P38999	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	FAA2	P39518	744 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ERP2	P39704	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GTT3	P39996	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PRM2	P40534	656 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MND2	P40577	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ASG7	P46993	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ZAP1	P47043	880 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YJL007C	P47080	104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YJR054W	P47114	497 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ALT1	P52893	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PEX8	P53248	589 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YGR127W	P53275	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	KIN4	Q01919	800 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RSM24	Q03976	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	SMP3	Q04174	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MGR3	Q04472	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CDC123	Q05791	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GMC2	Q06201	188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	LOT6	Q07923	191 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	SPE1	P08432	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MSS18	P08593	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GCN3	P14741	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	NMT1	P14743	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	AMD2	P22580	549 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	VBA3	P25594	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MSH2	P25847	964 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PRR1	P28708	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PTP2	P29461	750 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ITR2	P30606	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RAD16	P31244	790 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	VBA5	P36172	582 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YMC2	P38087	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	TBS1	P38114	1094 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ATG12	P38316	186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	BRL1	P38770	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MEF2	P39677	819 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	FIR1	P40020	876 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	IES5	P40060	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MET18	P40469	1032 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RRT5	P43607	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	STB2	P46679	850 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	IML2	P47031	731 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	AZR1	P50080	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YPR003C	P53394	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YNL058C	P53947	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CIK1	Q01649	594 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PEX29	Q03370	554 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CSN9	Q03981	162 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ECM7	Q06200	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RSB1	Q08417	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	SGT1	Q08446	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GYP1	Q08484	637 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MUM3	Q08750	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	REC8	Q12188	680 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ERP3	Q12403	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GSC2	P40989	1895 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.3 ms