RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	YPL068C	Q02749	293 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLX1	YBR228W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLX1	YBR228W	TPO3	Q06451	622 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLX1	YBR228W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLX1	YBR228W	BI2	P03873	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	ATP12	P22135	325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	MNT3	P40549	630 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	TDA10	P42938	290 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	AAC1	P04710	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	PEF1	P53238	335 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	YNL050C	P53952	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	ENT2	Q05785	613 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	RTT109	Q07794	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	CDC45	Q08032	650 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	CRC1	Q12289	327 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	RMP1	Q12530	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	EDE1	P34216	1381 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	YEL076C	P39971	216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	YUR1	P26725	428 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	NPR2	P39923	615 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	PCI8	P40512	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	SAE2	P46946	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	CRT10	Q08226	957 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	MAM1	P40065	302 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	STB2	P46679	850 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	IRC8	P47046	822 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	SKY1	Q03656	742 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	CYK3	Q07533	885 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	LYS2	P07702	1392 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	SPC97	P38863	823 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	ALE1	Q08548	619 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	VPS5	Q92331	675 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SLX1	YBR228W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	GDA1	P32621	518 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	ASK1	P35734	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	MTG2	P38860	518 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YIL024C	P40543	189 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	HRD3	Q05787	833 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	HER1	Q12276	1246 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	CWH43	P25618	953 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	CDC5	P32562	705 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	MEP2	P41948	499 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	IRC5	P43610	853 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	RMT2	Q03305	412 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	SDH8	P38345	138 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	IRC7	P43623	340 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	SPC105	P53148	917 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	RAD33	Q04231	177 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YOR378W	Q08902	515 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YPR089W	O13585	888 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	ARG1	P22768	420 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	HOS1	Q12214	470 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	STB5	P38699	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	FLO5	P38894	1075 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	EAF5	P39995	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	MNT2	P53059	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	COG2	P53271	262 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	ZDS2	P54786	942 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	AIM44	Q99299	758 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	DAL5	P15365	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	CBP3	P21560	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	MDG1	P53885	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YNL092W	P53934	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YML119W	Q03208	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	SSP2	Q08646	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX1	YBR228W	COQ3	P27680	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	LNP1	P38878	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
SLX1	YBR228W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	AAT1	Q01802	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	UBP16	Q02863	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	BUG1	Q12191	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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