RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 GPAA1O43292 621 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 GDF11O95390 407 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 APPP05067 770 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 DGKZQ13574 1117 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 ERO1AQ96HE7 468 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 WDR18Q9BV38 432 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L12C9JPN9 530 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L21D6R901 530 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 RILPL2Q969X0 211 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 GH2P01242 217 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 TDO2P48775 406 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 SP3Q02447 781 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 GABPAQ06546 454 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 C12orf60Q5U649 245 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 PNMA3Q9UL41 463 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 C19orf81C9J6K1 198 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 TLR2O60603 784 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L10C9JJH3 530 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 M0R2C6 588 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 SHMT1P34896 483 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF22Q14807 665 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC17Q96LX7 622 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 SIPA1L1O43166 1804 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC35A3-216ENST00000639221 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 NEFLP07196 543 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP2D6P10635 497 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 BACE1P56817 501 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 SBK1Q52WX2 424 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 CTR9Q6PD62 1173 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 FEZ1Q99689 392 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 HMGCS2P54868 508 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 MOGSQ13724 837 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 HIP1O00291 1037 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 OSBPP22059 807 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 MTMR2Q13614 643 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 NAPBQ9H115 298 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 CDK8P49336 464 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 USP14P54578 494 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 IFFO2Q5TF58 517 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 JAG1P78504 1218 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 SH2D4AQ9H788 454 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 EFCC1Q9HA90 598 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 TRIM17Q9Y577 477 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP2C8P10632 490 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 C17orf99Q6UX52 265 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 ABHD8Q96I13 439 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 CPA4Q9UI42 421 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 SDSP20132 328 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 PDE4BQ07343 736 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 SEPT2Q15019 361 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-216ENST00000639221 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms