RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R2P41236 205 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 GUCY2FP51841 1108 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRD1A4D1F6 860 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC138Q96M89 665 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTPRJ-207ENST00000613246 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 MED10Q9BTT4 135 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 NUCB1Q02818 461 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 PICK1Q9NRD5 415 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 ECE1P42892 770 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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PTPRJ-207ENST00000613246 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 HFM1A2PYH4 1435 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 PLCG2P16885 1265 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 PLCD1P51178 756 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 AFAP1Q8N556 730 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRJ-207ENST00000613246 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS6KA1Q15418 735 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 RAPH1Q70E73 1250 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP19Q96LK0 163 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 RLBP1P12271 317 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRJ-207ENST00000613246 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRJ-207ENST00000613246 SPC25Q9HBM1 224 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 PFDN6O15212 129 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 FLOT1O75955 427 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE6AP16499 860 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM50Q86XT4 487 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 HECW1Q76N89 1606 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 NPR1P16066 1061 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 NBPF3Q9H094 633 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC8A1P32418 973 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC12A1Q13621 1099 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 MYCT1Q8N699 235 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRP3Q96P20 1036 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 HS1BP3Q53T59 392 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 NRBF2Q96F24 287 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 HAUS1Q96CS2 278 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 JAG2Q9Y219 1238 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF217Q8TC41 542 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 P4HA1P13674 534 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 PAK1Q13153 545 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 M0QZ92 97 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V1AP38606 617 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 THAP12O43422 761 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-207ENST00000613246 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.5■□□□□ 0.87
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