RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRIN3BO60391 1043 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SKIP12755 728 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BPIFB4P59827 614 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NBPF4Q96M43 638 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SETDB2Q96T68 719 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCHHQ07283 1943 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STAM2O75886 525 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HSPA2P54652 639 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CFAP58Q5T655 872 aa5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRT86O43790 486 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEXIO95424 95 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AMPD2Q01433 879 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNGA4Q8IV77 575 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1B0GUA9 196 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LTN1O94822 1766 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC96Q2M329 555 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM9CQ8IZT9 166 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBR1Q8IWV7 1749 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MUTP22033 750 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 METTL24Q5JXM2 366 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HSPA6P17066 643 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KIF5AQ12840 1032 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCNG2Q16589 344 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HELLSQ9NRZ9 838 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STRN3Q13033 797 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTRQ99707 1265 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EXOC1Q9NV70 894 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNF14Q9UBS8 474 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 20.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCND2Q9NZV8 630 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP31Q70CQ4 1352 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AK8Q96MA6 479 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMC6Q96SB8 1091 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TFDP1Q14186 410 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM167AQ96KS9 214 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.05□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTPRUQ92729 1446 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GOLGA8AA7E2F4 631 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRMT3O60678 531 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSPY3P0CV98 308 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSPY8P0CW00 308 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRPC3Q13507 836 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPECC1Q5M775 1068 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP23Q9P227 1491 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MX1P20591 662 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINS1Q8NG48 757 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM50BQ9Y247 325 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATRNO75882 1429 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANXA13P27216 316 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALDH1A1P00352 501 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ERO1AQ96HE7 468 aa5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EVI5O60447 810 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms