RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499326.1

GABPB1-AS1-201, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 717 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UBE4AQ14139 1066 aa10.04□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.04□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.04□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.04□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.04□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NBPF3Q9H094 633 aa10.04□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CXCL11O14625 94 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM151AQ8WW52 585 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM161BQ96MY7 647 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MRIQ9BWK5 157 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.03□□□□□ -0.8
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RLBP1P12271 317 aa10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TCP10Q12799 353 aa10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HRO43593 1189 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TRIM32Q13049 653 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 VPS37DQ86XT2 251 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 COA7Q96BR5 231 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZHX2Q9Y6X8 837 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UTYO14607 1347 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PFASO15067 1338 aa10.01□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MUC3AQ02505 3323 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PHF20L1A8MW92 1017 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GRM8O00222 908 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MS4A1P11836 297 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NFIAQ12857 509 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GADL1Q6ZQY3 521 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PANK1Q8TE04 598 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HMGCRP04035 888 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PTPRAP18433 802 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PDE3AQ14432 1141 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 USP44Q9H0E7 712 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GJD2Q9UKL4 321 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAST3O60307 1309 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.99□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CDH23Q9H251 3354 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MEIS3Q99687 375 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PICK1Q9NRD5 415 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.98□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TRIM75PA6NK02 468 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLURP2P0DP57 97 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 COL6A1P12109 1028 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TREML2Q5T2D2 321 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KAZALD1Q96I82 304 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SUCLG2Q96I99 432 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PDE8BO95263 885 aa9.96□□□□□ -0.82
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LRRC24Q50LG9 513 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.7 ms