RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 SEMA3EO15041 775 aa22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 WDR44Q5JSH3 913 aa22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 RGS22Q8NE09 1264 aa22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 MAP4K1Q92918 833 aa22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 PDE8BO95263 885 aa22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 DNM3Q9UQ16 869 aa22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 MED23Q9ULK4 1368 aa22.78■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 ADCY9O60503 1353 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGAP6O43182 974 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 GALNT17Q6IS24 598 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 FNBP1Q96RU3 617 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 CABP7Q86V35 215 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 TEKT1Q969V4 418 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC24Q50LG9 513 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 IFT74Q96LB3 600 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.77■■□□□ 1.24
LRIG1-201ENST00000273261 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.77■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 PALD1Q9ULE6 856 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 ATP10DQ9P241 1426 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 DDAH1O94760 285 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 MTMR6Q9Y217 621 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 FANCBQ8NB91 859 aa22.76■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 ERBB3P21860 1342 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 ZBED4O75132 1171 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 SIK1P57059 783 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 FGAP02671 866 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 TTC14Q96N46 770 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.75■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CHRNDQ07001 517 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 FAM212AQ96EL1 285 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CHMP2AO43633 222 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.74■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 TNFAIP3P21580 790 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 ASIC2Q16515 512 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 PROSER3Q2NL68 480 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 USP40Q9NVE5 1235 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 DLGAP5Q15398 846 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 TNKSO95271 1327 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 GYG1P46976 350 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 BCAMP50895 628 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 PLCB3Q01970 1234 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.73■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 SP4Q02446 784 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 BIRC3Q13489 604 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 NIM1KQ8IY84 436 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 BLIDQ8IZY5 108 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 GREM2Q9H772 168 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 SMCO2A6NFE2 343 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CALCOCO2Q13137 446 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 NELFBQ8WX92 580 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CMA1P23946 247 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 GJC1P36383 396 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 GTF2IP78347 998 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC51Q96ER9 411 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.72■■□□□ 1.23
LRIG1-201ENST00000273261 NCAPD2Q15021 1401 aa22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms