RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064433.10

Tmod2-201, Transcript of Tropomodulin-2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tmod2, Length 9,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Tep1P97499 2629 aa6.8□□□□□ -1.32
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm3233E9Q2H5 230 aa6.8□□□□□ -1.32
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm19426M0QWC7 77 aa6.79□□□□□ -1.32
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm10139O88245 57 aa6.77□□□□□ -1.32
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm10320E9PW43 113 aa6.77□□□□□ -1.33
Tmod2-201ENSMUST00000064433 BC029722A0A0N4SW31 51 aa6.75□□□□□ -1.33
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Cystm1Q8K353 104 aa6.73□□□□□ -1.33
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Jbts17Q8CE72 3214 aa6.73□□□□□ -1.33
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Chd6A3KFM7 2711 aa6.72□□□□□ -1.33
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Igsf10Q3V1M1 2594 aa6.71□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 1700042G07RikB1AUF7 90 aa6.7□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm7138L7N2C3 230 aa6.69□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm3238W4VSP7 230 aa6.69□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa6.68□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm16253D3Z167 63 aa6.68□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Golgb1E9PVZ8 3238 aa6.68□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Itpr3P70227 2670 aa6.66□□□□□ -1.34
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa6.64□□□□□ -1.35
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm7137J3QMW1 236 aa6.62□□□□□ -1.35
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Stab2Q8R4U0 2559 aa6.62□□□□□ -1.35
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Sprr1aQ62266 144 aa6.61□□□□□ -1.35
Tmod2-201ENSMUST00000064433 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa6.61□□□□□ -1.35
Tmod2-201ENSMUST00000064433 4933415A04RikQ9D443 101 aa6.58□□□□□ -1.36
Tmod2-201ENSMUST00000064433 CenpfE9Q3P4 2997 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa6.57□□□□□ -1.36
Tmod2-201ENSMUST00000064433 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa6.56□□□□□ -1.36
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Cox6b2Q80ZN9 88 aa6.55□□□□□ -1.36
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa6.54□□□□□ -1.36
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Krtap29-1A2A5X4 342 aa6.52□□□□□ -1.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Col6a5A6H584 2640 aa6.52□□□□□ -1.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ubr5Q80TP3 2792 aa6.51□□□□□ -1.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Pkd1l1Q8R526 2615 aa6.5□□□□□ -1.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm17349F7BGH6 99 aa6.49□□□□□ -1.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Itpr1P11881 2749 aa6.48□□□□□ -1.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm9112A2AI92 75 aa6.46□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa6.46□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Prune2Q52KR3 3084 aa6.45□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ash1lQ99MY8 2958 aa6.45□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 ApcQ61315 2845 aa6.42□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Bod1lE9Q6J5 3032 aa6.41□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Itpr2Q9Z329 2701 aa6.4□□□□□ -1.38
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm21887J3QQ04 176 aa6.4□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Krtap13O88375 197 aa6.38□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Lelp1Q9DAE3 120 aa6.38□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Tex15F8VPN2 2785 aa6.35□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Tnp1P10856 55 aa6.35□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Cep350E9Q309 3095 aa6.34□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa6.34□□□□□ -1.39
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Krtap14O08640 167 aa6.34□□□□□ -1.4
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm2310J3QNJ2 377 aa6.34□□□□□ -1.4
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rps29P62274 56 aa6.3□□□□□ -1.4
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa6.27□□□□□ -1.41
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm11565A2A4M7 156 aa6.26□□□□□ -1.41
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa6.26□□□□□ -1.41
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Tnrc18Q80WC3 2878 aa6.24□□□□□ -1.41
Tmod2-201ENSMUST00000064433 UtrnE9Q6R7 3430 aa6.21□□□□□ -1.41
Tmod2-201ENSMUST00000064433 FcgbpE9Q0B5 2583 aa6.21□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 KalrnA2CG49 2964 aa6.2□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa6.2□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 SmcpP15265 143 aa6.18□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm9507D3Z5T3 223 aa6.18□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
Tmod2-201ENSMUST00000064433 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Hivep1Q03172 2688 aa6.14□□□□□ -1.43
Tmod2-201ENSMUST00000064433 TgO08710 2766 aa6.13□□□□□ -1.43
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Fbn2Q61555 2907 aa6.13□□□□□ -1.43
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Muc2Q80Z19 2680 aa6.12□□□□□ -1.43
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Krtap10-4Q08EG8 221 aa6.11□□□□□ -1.43
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Zzef1Q5SSH7 2924 aa6.08□□□□□ -1.44
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Tnp2P11378 117 aa6.07□□□□□ -1.44
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Igfn1Q3KNY0 2849 aa6.06□□□□□ -1.44
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa6.05□□□□□ -1.44
Tmod2-201ENSMUST00000064433 TrioQ0KL02 3102 aa6.02□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 FlncQ8VHX6 2726 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa6□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm5965D3Z724 196 aa5.99□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa5.99□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Chd9Q8BYH8 2885 aa5.98□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 LrbaQ9ESE1 2856 aa5.97□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Tenm1Q9WTS4 2731 aa5.97□□□□□ -1.45
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Gm20537G3UYK7 97 aa5.96□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 FrylF8VQ05 3007 aa5.96□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 FryE9Q8I9 3020 aa5.94□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Pdzd2E9Q1M1 2796 aa5.93□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Dmxl2Q8BPN8 3032 aa5.92□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa5.92□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Rev3lQ61493 3122 aa5.91□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa5.91□□□□□ -1.46
Tmod2-201ENSMUST00000064433 Frem2Q6NVD0 3160 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67 ms