Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
Cep350E9Q309 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Cep350E9Q309 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cep350E9Q309 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Cep350E9Q309 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Cep350E9Q309 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cep350E9Q309 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cep350E9Q309 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cep350E9Q309 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cep350E9Q309 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cep350E9Q309 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Cep350E9Q309 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cep350E9Q309 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cep350E9Q309 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cep350E9Q309 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cep350E9Q309 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cep350E9Q309 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cep350E9Q309 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cep350E9Q309 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cep350E9Q309 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cep350E9Q309 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cep350E9Q309 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cep350E9Q309 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cep350E9Q309 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep350E9Q309 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cep350E9Q309 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cep350E9Q309 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Cep350E9Q309 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cep350E9Q309 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cep350E9Q309 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cep350E9Q309 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cep350E9Q309 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Cep350E9Q309 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cep350E9Q309 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cep350E9Q309 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cep350E9Q309 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cep350E9Q309 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cep350E9Q309 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cep350E9Q309 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cep350E9Q309 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Cep350E9Q309 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cep350E9Q309 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
Cep350E9Q309 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cep350E9Q309 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Cep350E9Q309 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cep350E9Q309 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cep350E9Q309 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cep350E9Q309 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cep350E9Q309 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep350E9Q309 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep350E9Q309 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cep350E9Q309 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cep350E9Q309 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cep350E9Q309 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cep350E9Q309 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cep350E9Q309 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cep350E9Q309 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Cep350E9Q309 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cep350E9Q309 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cep350E9Q309 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cep350E9Q309 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cep350E9Q309 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cep350E9Q309 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cep350E9Q309 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cep350E9Q309 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cep350E9Q309 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Cep350E9Q309 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cep350E9Q309 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cep350E9Q309 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cep350E9Q309 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cep350E9Q309 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cep350E9Q309 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Cep350E9Q309 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cep350E9Q309 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cep350E9Q309 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cep350E9Q309 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cep350E9Q309 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cep350E9Q309 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cep350E9Q309 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cep350E9Q309 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cep350E9Q309 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cep350E9Q309 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cep350E9Q309 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cep350E9Q309 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cep350E9Q309 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cep350E9Q309 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cep350E9Q309 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cep350E9Q309 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cep350E9Q309 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cep350E9Q309 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Cep350E9Q309 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cep350E9Q309 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cep350E9Q309 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cep350E9Q309 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cep350E9Q309 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cep350E9Q309 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cep350E9Q309 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cep350E9Q309 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cep350E9Q309 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cep350E9Q309 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms