RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6812B1AXU1 112 aa9.27□□□□□ -0.93
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2d2P62838 147 aa9.26□□□□□ -0.93
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anapc13Q8R034 74 aa9.22□□□□□ -0.93
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v0e2Q91XE7 81 aa9.19□□□□□ -0.94
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp5lQ9CPQ8 103 aa9.19□□□□□ -0.94
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa9.18□□□□□ -0.94
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LeprotO89013 131 aa9.18□□□□□ -0.94
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifi27l2aQ8R412 90 aa9.18□□□□□ -0.94
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam216aQ9DB54 251 aa9.18□□□□□ -0.94
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AI854703Q8BIN3 203 aa9.17□□□□□ -0.94
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20730A0A075B5J6 119 aa9.17□□□□□ -0.94
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam110dQ80X91 271 aa9.16□□□□□ -0.94
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav13d-1A0A075B606 110 aa9.15□□□□□ -0.95
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb1b24B1B0N6 92 aa9.14□□□□□ -0.95
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TtrP07309 147 aa9.14□□□□□ -0.95
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VwfQ8CIZ8 2813 aa9.14□□□□□ -0.95
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr13Q9CQJ5 137 aa9.12□□□□□ -0.95
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