RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W VPS8P39702 1274 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SAP1P39955 897 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W IES1P43579 692 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PSP1P50896 841 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ESBP6P53918 673 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W IZH1Q03419 316 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W NSE5Q03718 556 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YMR254CQ04838 102 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ARP9Q05123 467 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CRT10Q08226 957 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W AIM41Q12032 185 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W TAH18Q12181 623 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CHO2P05374 869 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PDA1P16387 420 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W BET2P20133 325 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ARN1P38731 627 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SIM1P40472 476 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W NOP2P40991 618 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YJL049WP47048 450 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ORC5P50874 479 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W COG2P53271 262 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W BOR1P53838 576 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W UBP16Q02863 499 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PLM2Q04383 521 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W COG8Q04632 607 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W DAP1Q12091 152 aa0.51□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W HMG2P12684 1045 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PRO3P32263 286 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PLC1P32383 869 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W HXT1P32465 570 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W DSS4P32601 143 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W RMA1P36001 430 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data0.5□□□□□ -2.33not detected
RDS3YPR094W YHR033WP38690 423 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CDC1P40986 491 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W BFA1P47113 574 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W RBG2P53295 368 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SMA1Q02651 245 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YML053CQ04978 212 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W LCB4Q12246 624 aa0.5□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W FAB1P34756 2278 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CYB2P00175 591 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SES1P07284 462 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W BAR1P12630 587 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CDC26P14724 124 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W BUD14P27637 709 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SDH8P38345 138 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PTH1P38876 190 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W LAS21P40367 830 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YPI1P43587 155 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ATG27P46989 271 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W VPS25P47142 202 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W MET13P53128 600 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W EAF7P53911 425 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YAT1P80235 687 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CAC2Q04199 468 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PDR8Q06149 701 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W POS5Q06892 414 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YLL056CQ12177 298 aa0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SOD1P00445 154 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CBP1P07252 654 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W MGR1P25573 417 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W MF(ALPHA)2P32435 120 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W RAD24P32641 659 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W TIM23P32897 222 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W LEU5P38702 357 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W TPA1P40032 644 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W MAM1P40065 302 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PRE5P40302 234 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YPR003CP53394 754 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YDL242WQ07746 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PPT2Q12036 173 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W DIN7Q12086 430 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YDL012CQ12489 107 aa0.48□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W TUF1P02992 437 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CBP3P21560 335 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PTC6P25646 442 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W MSH1P25846 959 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SEC65P29478 273 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W OCT1P35999 772 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PAM1P37304 830 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W RIM2P38127 377 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W FAT1P38225 669 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W HXT6P39003 570 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W HXT7P39004 570 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YJR061WP40355 935 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W VID28P40547 921 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SMK1P41808 388 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W GSM1P42950 618 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W IML2P47031 731 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ASK10P48361 1146 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W COS12P53053 380 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W RNH70P53331 553 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W ECI1Q05871 280 aa0.47□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PIG1Q06216 648 aa0.47□□□□□ -2.33
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