RNA–Protein interactions for RNA: YPR003C

YPR003C, Transcript of Putative sulfate permease, yeast

Gene YPR003C, Length 2,265 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR003C	YPR003C	PTC5	Q12511	572 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YPR003C	YPR003C	ENA5	Q12691	1091 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YPR003C	YPR003C	TRP3	P00937	484 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SIR3	P06701	978 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SPO11	P23179	398 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SPS22	P25380	463 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	NAM9	P27929	486 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	ZIP1	P31111	875 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	GDA1	P32621	518 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SPT10	P35208	640 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	TGL4	P36165	910 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.9	□□□□□ -1.79	not detected
YPR003C	YPR003C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	POP7	P38291	140 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	VFA1	P40080	203 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SNL1	P40548	159 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	AXL1	P40851	1208 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	DAK2	P43550	591 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	YGL176C	P46945	554 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	TAD1	P53065	400 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SPC105	P53148	917 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MNT4	P53745	580 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	TRS130	Q03660	1102 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	NSE5	Q03718	556 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SIL1	Q08199	421 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MED2	Q12124	431 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	TIP41	Q12199	356 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SCM3	Q12334	223 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	CTT1	P06115	562 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	URA4	P20051	364 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	AMS1	P22855	1083 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	PUP1	P25043	261 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MYO3	P36006	1272 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	ERT1	P38140	529 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	GIP1	P38229	639 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	BSD2	P38356	321 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SOH1	P38633	127 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	STP2	P38704	541 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	YHR054C	P38780	354 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	YEN1	P40028	759 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MDJ2	P42834	146 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MNT2	P53059	558 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	UBP16	Q02863	499 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SPO20	Q04359	397 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	PNP1	Q05788	311 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	PHO92	Q06390	306 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	RSC58	Q07979	502 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	RSA1	Q08932	381 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	LAP2	Q10740	671 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	AEP3	Q12089	606 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	OCA6	Q12454	224 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	LAG2	Q92325	660 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SEY1	Q99287	776 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	DBF20	P32328	564 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	FES1	P38260	290 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	NMD5	P46970	1048 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	LIF1	P53150	421 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MEC3	Q02574	474 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MSH5	Q12175	901 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	HMS1	Q12398	434 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	AHC1	Q12433	566 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	ARP6	Q12509	438 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	MET3	P08536	511 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YPR003C	YPR003C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.2 ms