RNA–Protein interactions for RNA: YOR258W

HNT3, Transcript of DNA 5' AMP hydrolase involved in DNA repair, yeast

Gene HNT3, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HNT3	YOR258W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	RIT1	P23796	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	JNM1	P36224	373 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	CDS1	P38221	457 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	YEL068C	P39977	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	YIL077C	P40508	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	VID22	Q05934	901 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	AAD4	Q07747	329 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	TUP1	P16649	713 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	SEC15	P22224	910 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	KIN82	P25341	720 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	EHT1	P38295	451 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	YLF2	P38746	405 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
HNT3	YOR258W	ESL1	P40456	1118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	MDG1	P53885	366 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	TRI1	Q05024	226 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	RKI1	Q12189	258 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	POM34	Q12445	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	RTP1	Q12751	981 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	TPK2	P06245	380 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	PCK1	P10963	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	AAC3	P18238	307 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	YUR1	P26725	428 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	NTH1	P32356	751 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	STB5	P38699	743 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	VPS8	P39702	1274 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	FTR1	P40088	404 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	YDL183C	P48569	320 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	SAP4	P53036	818 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	SPO1	P53541	631 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	CBK1	P53894	756 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	STP1	Q00947	519 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	TIM50	Q02776	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	ERP4	Q12450	207 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	PCD1	Q12524	340 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HNT3	YOR258W	FOB1	O13329	566 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
HNT3	YOR258W	BET2	P20133	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	IMP2'	P32351	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	HOT13	P36078	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	COS111	P38308	924 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	UME6	P39001	836 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	YER010C	P40011	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	GSM1	P42950	618 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	CTF18	P49956	741 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	ARA2	Q04212	335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	SNO4	Q04902	237 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	TFC6	Q06339	672 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	HSP32	Q08992	237 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	ICL2	Q12031	575 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	AAD3	P25612	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	RAD16	P31244	790 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	PAH1	P32567	862 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	MRPL36	P36531	177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	CAB2	P40506	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	STB2	P46679	850 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	CRD1	Q07560	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	AIM41	Q12032	185 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	COX17	Q12287	69 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	NFU1	P32860	256 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	TMN3	P40071	706 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	VFA1	P40080	203 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	LYS14	P40971	790 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	POL31	P46957	487 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	UFO1	Q04511	668 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	ARG7	Q04728	441 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	ORM2	Q06144	216 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	YFT2	Q06676	274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	MBR1	P23493	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	CNS1	P33313	385 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	ELF1	P36053	145 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	NPR3	P38742	1146 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	SRB7	P47822	140 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	TRS31	Q03337	283 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	SDH5	Q08230	162 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HNT3	YOR258W	GEP3	Q08622	556 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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