RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W CDC9P04819 755 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W AGP1P25376 633 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W DOM34P33309 386 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YGL138CP53122 345 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W HOL1P53389 586 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SVS1Q12254 260 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W PLC1P32383 869 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W EXO5P38289 585 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RGA1P39083 1007 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W STU2P46675 888 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YLH47Q06493 454 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MLC2Q06580 163 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ERR1P0CX10 437 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ERR2P0CX11 437 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W EMP65P40085 556 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SAP185P40856 1058 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YTP1P53584 459 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W PPN1Q04119 674 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W CRD1Q07560 283 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MDM38Q08179 573 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W NIC96P34077 839 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W DYS1P38791 387 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YNL193WP53870 558 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RNH1Q04740 348 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ENT4Q07872 247 aa3.02□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YKR104WP0CE69 306 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W FUR1P18562 216 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W LYP1P32487 611 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YKL100CP34248 587 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RRN3P36070 627 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YFL054CP43549 646 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YGL108CP53139 140 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W NRM1P53718 249 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ADI1Q03677 179 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SHE9Q04172 456 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ARG7Q04728 441 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MCA1Q08601 432 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W TCP1P12612 559 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SPS22P25380 463 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W PEX13P80667 386 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W NUP53Q03790 475 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YDL211CQ12121 372 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W WSC3Q12215 556 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W BAP2P38084 609 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W BST1P43571 1029 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RMD8P43620 662 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MET14Q02196 202 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W GYP1Q08484 637 aa3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ASP3-2P0CX77 362 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ASP3-3P0CX78 362 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ASP3-4P0CX79 362 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ASP3-1P0CZ17 362 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W AEP2P22136 580 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YGL015CP33199 130 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W IRS4P36115 615 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SEO1P39709 593 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W BCY1P07278 416 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W KIN3P22209 435 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data3□□□□□ -1.93not detected
SIN3YOL004W SUL1P38359 859 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YAL037WP39728 267 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W EMW1P42842 904 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MON1P53129 644 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W VHS1Q03785 461 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RCN2Q12044 265 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W CDC31P06704 161 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SWI5P08153 709 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SCL1P21243 252 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W RRT12P25381 491 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SRB5P32585 307 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ORC2P32833 620 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MOH1P38191 138 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YBR071WP38243 211 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W BSC5P53755 489 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W FCP1Q03254 732 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W COG8Q04632 607 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MDM12Q92328 271 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MRPL33P20084 86 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W TGL1P34163 548 aa3□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SKT5P34226 696 aa3□□□□□ -1.93
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