RNA–Protein interactions for RNA: YHR187W

IKI1, Transcript of Subunit of hexameric RecA-like ATPase Elp456 Elongator subcomplex, yeast

Gene IKI1, Length 930 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKI1	YHR187W	GDA1	P32621	518 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	BST1	P43571	1029 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	MAD3	P47074	515 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	UBP16	Q02863	499 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	LCB4	Q12246	624 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	SIR1	P21691	654 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	BEM3	P32873	1128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	XBP1	P40489	647 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	HIS6	P40545	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	QRI7	P43122	407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	SNO3	P43544	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	NET1	P47035	1189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	CRF1	Q04930	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	CYK3	Q07533	885 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	AFT2	Q08957	416 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	VPS8	P39702	1274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	AAT1	Q01802	451 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	YML119W	Q03208	357 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	PLM2	Q04383	521 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	NYV1	Q12255	253 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	PIF1	P07271	859 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	PDE1	P22434	369 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	MSH1	P25846	959 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	APM3	P38153	483 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	CAB2	P40506	365 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	ATG21	Q02887	496 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	ARA2	Q04212	335 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	MSS18	P08593	268 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	MAK32	P23060	363 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	TPO3	Q06451	622 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	FRE7	Q12333	620 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IKI1	YHR187W	BIK1	P11709	440 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	POL3	P15436	1097 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	SIP1	P32578	815 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	SNM1	P40993	198 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	IRC7	P43623	340 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	YAT1	P80235	687 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	RSC9	Q03124	581 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	YML053C	Q04978	212 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	FTH1	P38310	465 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	GLO1	P50107	326 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	IMA1	P53051	589 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	ICL2	Q12031	575 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	ICT1	Q12385	394 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	YHL041W	P38730	149 aa		4	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	HIM1	Q06674	414 aa		4	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	PHO81	P17442	1178 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	RIT1	P23796	513 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	CIN1	P40987	1014 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	SKP2	P42843	763 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	SEC5	P89102	971 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	STP1	Q00947	519 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	GTB1	Q04924	702 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	RAD34	Q06665	692 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IKI1	YHR187W	YOL057W	Q08225	711 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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