RNA–Protein interactions for RNA: YGR104C

SRB5, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene SRB5, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRB5	YGR104C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	HFD1	Q04458	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	TAH18	Q12181	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	TAF3	Q12297	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	KSS1	P14681	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	PDX1	P16451	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	CBF2	P32504	956 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	VPS17	P32913	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	BUD2	P33314	1104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	SWH1	P35845	1188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	SLX1	P38324	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	FTR1	P40088	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ARG2	P40360	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ERR3	P42222	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	POL31	P46957	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ALY2	P47029	1046 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	MAD3	P47074	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	RTA1	P53047	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	PCL10	P53124	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YGR266W	P53326	701 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YNL144C	P53907	740 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ADA2	Q02336	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	TIM50	Q02776	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ARR1	Q06596	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	SUT2	Q12286	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	PUT4	P15380	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	PHO81	P17442	1178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ITR1	P30605	584 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	HIR2	P32480	875 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	MRP4	P32902	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	BYE1	P36106	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ECM4	P36156	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	PEX32	P38292	413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YLF2	P38746	405 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YJL206C	P39529	758 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	NDC80	P40460	691 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	MDR1	P53258	950 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	VPS9	P54787	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ORC4	P54791	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	YML119W	Q03208	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	RRN11	Q04712	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	ASM4	Q05166	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	MCM21	Q06675	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRB5	YGR104C	MET8	P15807	274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	AAC3	P18238	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	CBP3	P21560	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	MSH1	P25846	959 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	BUD14	P27637	709 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	PAH1	P32567	862 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	MDL1	P33310	695 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	UIP5	P36137	443 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	BUD16	P39988	312 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	PKP1	P40530	394 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	INA22	P40576	216 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	CTR1	P49573	406 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	MAL11	P53048	616 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	ARP5	P53946	755 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	INP2	Q03824	705 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	HOF1	Q05080	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	ARO10	Q06408	635 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	MSS18	P08593	268 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	SPO11	P23179	398 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	MIH1	P23748	554 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	MNE1	P24720	663 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	ADY2	P25613	283 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	PTR2	P32901	601 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	SET3	P36124	751 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	GLG1	P36143	616 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	PSY4	P38193	441 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	YSW1	P38280	609 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	BDH2	P39713	417 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	KHA1	P40309	873 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	YJL068C	P40363	299 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	YIR014W	P40570	242 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	BNA2	P47125	453 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	RPN14	P53196	417 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRB5	YGR104C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.1 ms