RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-205	ENST00000466861	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	PALD1	Q9ULE6	856 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	INPP5B	P32019	993 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	SREBF2	Q12772	1141 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	ELP3	Q9H9T3	547 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SUMO3-205	ENST00000466861	CHGB	P05060	677 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	PDE4A	P27815	886 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	PPAT	Q06203	517 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	OPTN	Q96CV9	577 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	GINM1	Q9NU53	330 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	TM4SF4	P48230	202 aa		28	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		28	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		28	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	ZIC5	Q96T25	663 aa		28	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	DOCK1	Q14185	1865 aa		28	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	PPIL2	Q13356	520 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	GPAA1	O43292	621 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	PICK1	Q9NRD5	415 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	GJA5	P36382	358 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	HIP1	O00291	1037 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	PRKAB2	O43741	272 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	CAP2	P40123	477 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	GTF2A2	P52657	109 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	RILPL2	Q969X0	211 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SUMO3-205	ENST00000466861	GABPA	Q06546	454 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	TTC22	Q5TAA0	569 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	DNAJC18	Q9H819	358 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861		M0R2C6	588 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	SBK1	Q52WX2	424 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	FAM196B	A6NMK8	535 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	CXCL11	O14625	94 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	PLCD1	P51178	756 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	SWAP70	Q9UH65	585 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	ASNS	P08243	561 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	PTPRA	P18433	802 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	SDS	P20132	328 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	C12orf60	Q5U649	245 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	USP17L12	C9JPN9	530 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	USP17L21	D6R901	530 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	IRF6	O14896	467 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	SLURP2	P0DP57	97 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	CETP	P11597	493 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	FOXN1	O15353	648 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	CTR9	Q6PD62	1173 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	RNF186	Q9NXI6	227 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	PCNT	O95613	3336 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SUMO3-205	ENST00000466861	USP17L5	A8MUK1	530 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SUMO3-205	ENST00000466861	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SUMO3-205	ENST00000466861	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SUMO3-205	ENST00000466861	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		27.88	■■■□□ 2.05

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