RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.8□□□□□ -1.8
SPIN3-241ENST00000640511 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.78□□□□□ -1.8
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.77□□□□□ -1.81
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.76□□□□□ -1.81
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.76□□□□□ -1.81
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.74□□□□□ -1.81
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.73□□□□□ -1.81
SPIN3-241ENST00000640511 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
SPIN3-241ENST00000640511 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.69□□□□□ -1.82
SPIN3-241ENST00000640511 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SPIN3-241ENST00000640511 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.68□□□□□ -1.82
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.68□□□□□ -1.82
SPIN3-241ENST00000640511 MT1LQ93083 61 aa3.68□□□□□ -1.82
SPIN3-241ENST00000640511 PRM1P04553 51 aa3.65□□□□□ -1.82
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.61□□□□□ -1.83
SPIN3-241ENST00000640511 LCE1EQ5T753 118 aa3.59□□□□□ -1.84
SPIN3-241ENST00000640511 MT1EP04732 61 aa3.57□□□□□ -1.84
SPIN3-241ENST00000640511 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SPIN3-241ENST00000640511 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SPIN3-241ENST00000640511 MT1GP13640 62 aa3.53□□□□□ -1.84
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.5□□□□□ -1.85
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPIN3-241ENST00000640511 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPIN3-241ENST00000640511 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.47□□□□□ -1.85
SPIN3-241ENST00000640511 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.46□□□□□ -1.85
SPIN3-241ENST00000640511 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.46□□□□□ -1.86
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.46□□□□□ -1.86
SPIN3-241ENST00000640511 MT1AP04731 61 aa3.45□□□□□ -1.86
SPIN3-241ENST00000640511 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.45□□□□□ -1.86
SPIN3-241ENST00000640511 LCE3BQ5TA77 95 aa3.44□□□□□ -1.86
SPIN3-241ENST00000640511 LCE1DQ5T752 114 aa3.44□□□□□ -1.86
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SPIN3-241ENST00000640511 MDN1Q9NU22 5596 aa3.33□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.3□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-9P26371 169 aa3.29□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 MT1MQ8N339 61 aa3.29□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.28□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 SPRR2EP22531 72 aa3.28□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 SPRR2BP35325 72 aa3.28□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 SPRR2AP35326 72 aa3.28□□□□□ -1.88
SPIN3-241ENST00000640511 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.22□□□□□ -1.89
SPIN3-241ENST00000640511 SPRR2DP22532 72 aa3.15□□□□□ -1.9
SPIN3-241ENST00000640511 LCE1FQ5T754 118 aa3.15□□□□□ -1.9
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.14□□□□□ -1.91
SPIN3-241ENST00000640511 NEBP20929 6669 aa3.07□□□□□ -1.92
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.93□□□□□ -1.94
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.93□□□□□ -1.94
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.88□□□□□ -1.95
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.88□□□□□ -1.95
SPIN3-241ENST00000640511 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.87□□□□□ -1.95
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.82□□□□□ -1.96
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.81□□□□□ -1.96
SPIN3-241ENST00000640511 MT4P47944 62 aa2.78□□□□□ -1.96
SPIN3-241ENST00000640511 MT3P25713 68 aa2.74□□□□□ -1.97
SPIN3-241ENST00000640511 LCE4AQ5TA78 99 aa2.73□□□□□ -1.97
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.73□□□□□ -1.97
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.71□□□□□ -1.98
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.61□□□□□ -1.99
SPIN3-241ENST00000640511 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.57□□□□□ -2
SPIN3-241ENST00000640511 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.5□□□□□ -2.01
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.46□□□□□ -2.01
SPIN3-241ENST00000640511 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.41□□□□□ -2.02
SPIN3-241ENST00000640511 LCE1CQ5T751 118 aa2.4□□□□□ -2.03
SPIN3-241ENST00000640511 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.4□□□□□ -2.03
SPIN3-241ENST00000640511 MUC5ACP98088 5654 aa2.39□□□□□ -2.03
SPIN3-241ENST00000640511 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.36□□□□□ -2.03
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.34□□□□□ -2.04
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.24□□□□□ -2.05
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-8O75690 187 aa2.16□□□□□ -2.06
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
SPIN3-241ENST00000640511 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.02□□□□□ -2.09
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.98□□□□□ -2.09
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.93□□□□□ -2.1
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.82□□□□□ -2.12
SPIN3-241ENST00000640511 PHGR1C9JFL3 82 aa1.56□□□□□ -2.16
SPIN3-241ENST00000640511 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
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