RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 FREM2Q5SZK8 3169 aa-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 CMC2Q9NRP2 79 aa-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1BP07438 61 aa-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1-232ENST00000636483 FRYLO94915 3013 aa-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1-232ENST00000636483 DMDP11532 3685 aa-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1-232ENST00000636483 NDUFA1O15239 70 aa-1.41□□□□□ -2.64
SPTAN1-232ENST00000636483 SZT2Q5T011 3432 aa-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1-232ENST00000636483 PCNTO95613 3336 aa-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1-232ENST00000636483 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1-232ENST00000636483 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
SPTAN1-232ENST00000636483 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-1.47□□□□□ -2.64
SPTAN1-232ENST00000636483 CEP250Q9BV73 2442 aa-1.48□□□□□ -2.65
SPTAN1-232ENST00000636483 SPEGQ15772 3267 aa-1.49□□□□□ -2.65
SPTAN1-232ENST00000636483 CEP350Q5VT06 3117 aa-1.5□□□□□ -2.65
SPTAN1-232ENST00000636483 TOMM7Q9P0U1 55 aa-1.53□□□□□ -2.65
SPTAN1-232ENST00000636483 MUC3AQ02505 3323 aa-1.53□□□□□ -2.65
SPTAN1-232ENST00000636483 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1-232ENST00000636483 IQGAP2Q13576 1575 aa-1.57□□□□□ -2.66
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-1.59□□□□□ -2.66
SPTAN1-232ENST00000636483 XIRP2A4UGR9 3374 aa-1.6□□□□□ -2.67
SPTAN1-232ENST00000636483 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-1.61□□□□□ -2.67
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1FP04733 61 aa-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1-232ENST00000636483 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1-232ENST00000636483 EP400Q96L91 3159 aa-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1-232ENST00000636483 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP7AQ04656 1500 aa-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 USP34Q70CQ2 3546 aa-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 CENPEQ02224 2701 aa-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A096LNI7 61 aa-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 TOMM5Q8N4H5 51 aa-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB133Q30KQ1 61 aa-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 MROH2BQ7Z745 1585 aa-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 HTN1P15515 57 aa-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 TTTY10Q9BZA0 68 aa-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 ASPMQ8IZT6 3477 aa-1.75□□□□□ -2.69
SPTAN1-232ENST00000636483 LOC400499M0QZD8 3231 aa-1.79□□□□□ -2.7
SPTAN1-232ENST00000636483 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-1.82□□□□□ -2.7
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.84□□□□□ -2.7
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-1.84□□□□□ -2.7
SPTAN1-232ENST00000636483 UNC80Q8N2C7 3258 aa-1.84□□□□□ -2.7
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB124Q8NES8 71 aa-1.87□□□□□ -2.71
SPTAN1-232ENST00000636483 BRCA2P51587 3418 aa-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1-232ENST00000636483 CD52P31358 61 aa-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1-232ENST00000636483 VCANP13611 3396 aa-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-2.03□□□□□ -2.73
SPTAN1-232ENST00000636483 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-2.05□□□□□ -2.74
SPTAN1-232ENST00000636483 CENPFP49454 3210 aa-2.08□□□□□ -2.74
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BUX3 64 aa-2.09□□□□□ -2.74
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC01556Q5JQF7 62 aa-2.1□□□□□ -2.75
SPTAN1-232ENST00000636483 CDH23Q9H251 3354 aa-2.11□□□□□ -2.75
SPTAN1-232ENST00000636483 K7EIM0 57 aa-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS13AQ96RL7 3174 aa-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1-232ENST00000636483 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PRCDQ00LT1 54 aa-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1-232ENST00000636483 APELAP0DMC3 54 aa-2.29□□□□□ -2.78
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A096LPF7 62 aa-2.3□□□□□ -2.78
SPTAN1-232ENST00000636483 UTRNP46939 3433 aa-2.35□□□□□ -2.78
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-2.37□□□□□ -2.79
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BSH0 61 aa-2.42□□□□□ -2.8
SPTAN1-232ENST00000636483 RPL39P5Q59GN2 51 aa-2.46□□□□□ -2.8
SPTAN1-232ENST00000636483 HTN3P15516 51 aa-2.52□□□□□ -2.81
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB108AA8MXU0 73 aa-2.53□□□□□ -2.81
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SPTAN1-232ENST00000636483 Q9Y3F1 56 aa-2.73□□□□□ -2.85
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB108BQ8NET1 73 aa-2.91□□□□□ -2.88
SPTAN1-232ENST00000636483 COX14Q96I36 57 aa-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1-232ENST00000636483 STATHP02808 62 aa-3.25□□□□□ -2.93
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms