RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.09□□□□□ -1.27
GIPC1-211ENST00000589631 LCE4AQ5TA78 99 aa6.98□□□□□ -1.29
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.96□□□□□ -1.3
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP12-3P60328 96 aa6.95□□□□□ -1.3
GIPC1-211ENST00000589631 LCE1DQ5T752 114 aa6.95□□□□□ -1.3
GIPC1-211ENST00000589631 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.94□□□□□ -1.3
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.86□□□□□ -1.31
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.86□□□□□ -1.31
GIPC1-211ENST00000589631 MT4P47944 62 aa6.85□□□□□ -1.31
GIPC1-211ENST00000589631 V9GYY9 64 aa6.84□□□□□ -1.31
GIPC1-211ENST00000589631 K7ERS5 55 aa6.83□□□□□ -1.32
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.81□□□□□ -1.32
GIPC1-211ENST00000589631 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.81□□□□□ -1.32
GIPC1-211ENST00000589631 Q1T7F1 81 aa6.79□□□□□ -1.32
GIPC1-211ENST00000589631 PSPHP1O15172 72 aa6.77□□□□□ -1.33
GIPC1-211ENST00000589631 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GIPC1-211ENST00000589631 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.75□□□□□ -1.33
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.68□□□□□ -1.34
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.64□□□□□ -1.35
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.64□□□□□ -1.35
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GIPC1-211ENST00000589631 A6NED7 52 aa6.55□□□□□ -1.36
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.5□□□□□ -1.37
GIPC1-211ENST00000589631 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.49□□□□□ -1.37
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.47□□□□□ -1.37
GIPC1-211ENST00000589631 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.45□□□□□ -1.38
GIPC1-211ENST00000589631 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.45□□□□□ -1.38
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.45□□□□□ -1.38
GIPC1-211ENST00000589631 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.45□□□□□ -1.38
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP12-4P60329 112 aa6.42□□□□□ -1.38
GIPC1-211ENST00000589631 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.41□□□□□ -1.38
GIPC1-211ENST00000589631 ROMO1P60602 79 aa6.35□□□□□ -1.39
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.33□□□□□ -1.4
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.23□□□□□ -1.41
GIPC1-211ENST00000589631 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
GIPC1-211ENST00000589631 MT1AP04731 61 aa6.12□□□□□ -1.43
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.07□□□□□ -1.44
GIPC1-211ENST00000589631 BRK1Q8WUW1 75 aa6.07□□□□□ -1.44
GIPC1-211ENST00000589631 PRO0628Q9UI54 55 aa6.03□□□□□ -1.44
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.02□□□□□ -1.45
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6□□□□□ -1.45
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.93□□□□□ -1.46
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.9□□□□□ -1.46
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.8□□□□□ -1.48
GIPC1-211ENST00000589631 SVIPQ8NHG7 77 aa5.77□□□□□ -1.49
GIPC1-211ENST00000589631 PMAIP1Q13794 54 aa5.76□□□□□ -1.49
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-8O75690 187 aa5.7□□□□□ -1.5
GIPC1-211ENST00000589631 MT3P25713 68 aa5.61□□□□□ -1.51
GIPC1-211ENST00000589631 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.57□□□□□ -1.52
GIPC1-211ENST00000589631 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.57□□□□□ -1.52
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.4□□□□□ -1.54
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.37□□□□□ -1.55
GIPC1-211ENST00000589631 MUC5ACP98088 5654 aa5.35□□□□□ -1.55
GIPC1-211ENST00000589631 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
GIPC1-211ENST00000589631 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
GIPC1-211ENST00000589631 PRAC1Q96KF2 57 aa5.3□□□□□ -1.56
GIPC1-211ENST00000589631 LCE1EQ5T753 118 aa5.18□□□□□ -1.58
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.86□□□□□ -1.63
GIPC1-211ENST00000589631 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.82□□□□□ -1.64
GIPC1-211ENST00000589631 LCE1CQ5T751 118 aa4.8□□□□□ -1.64
GIPC1-211ENST00000589631 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.62□□□□□ -1.67
GIPC1-211ENST00000589631 LUZP6Q538Z0 58 aa4.44□□□□□ -1.7
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.37□□□□□ -1.71
GIPC1-211ENST00000589631 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.34□□□□□ -1.71
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.33□□□□□ -1.72
GIPC1-211ENST00000589631 NDUFAF8A1L188 74 aa4.31□□□□□ -1.72
GIPC1-211ENST00000589631 LCE1FQ5T754 118 aa4.24□□□□□ -1.73
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.01□□□□□ -1.77
GIPC1-211ENST00000589631 H3BS24 57 aa3.96□□□□□ -1.78
GIPC1-211ENST00000589631 A0A0A0MQY5 61 aa3.92□□□□□ -1.78
GIPC1-211ENST00000589631 PHGR1C9JFL3 82 aa3.75□□□□□ -1.81
GIPC1-211ENST00000589631 INE1O15225 51 aa3.66□□□□□ -1.82
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.63□□□□□ -1.83
GIPC1-211ENST00000589631 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.41□□□□□ -1.86
GIPC1-211ENST00000589631 PRM1P04553 51 aa3.22□□□□□ -1.89
GIPC1-211ENST00000589631 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.87□□□□□ -1.95
GIPC1-211ENST00000589631 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.41□□□□□ -2.02
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