RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP12-1P59990 96 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-211ENST00000588374 UQCR11O14957 56 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-211ENST00000588374 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE1EQ5T753 118 aa2.67□□□□□ -1.98
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.67□□□□□ -1.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRR2EP22531 72 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRR2BP35325 72 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRR2AP35326 72 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-211ENST00000588374 KMT2DO14686 5537 aa2.62□□□□□ -1.99
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.6□□□□□ -1.99
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAC1Q96KF2 57 aa2.59□□□□□ -1.99
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.58□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.58□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.58□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRR2DP22532 72 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 TNP1P09430 55 aa2.55□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.55□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.54□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.53□□□□□ -2
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.52□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 K7ERS5 55 aa2.51□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 MT1EP04732 61 aa2.51□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE3AQ5TA76 89 aa2.5□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 NEBP20929 6669 aa2.49□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.49□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 MDN1Q9NU22 5596 aa2.48□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.47□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.47□□□□□ -2.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ROMO1P60602 79 aa2.45□□□□□ -2.02
EFTUD2-211ENST00000588374 MT1GP13640 62 aa2.44□□□□□ -2.02
EFTUD2-211ENST00000588374 MT1LQ93083 61 aa2.42□□□□□ -2.02
EFTUD2-211ENST00000588374 PP632Q6XCG6 107 aa2.41□□□□□ -2.02
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP12-3P60328 96 aa2.4□□□□□ -2.03
EFTUD2-211ENST00000588374 MT1MQ8N339 61 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.37□□□□□ -2.03
EFTUD2-211ENST00000588374 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
EFTUD2-211ENST00000588374 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.29□□□□□ -2.04
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0A0MQY5 61 aa2.26□□□□□ -2.05
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.26□□□□□ -2.05
EFTUD2-211ENST00000588374 MT4P47944 62 aa2.24□□□□□ -2.05
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.23□□□□□ -2.05
EFTUD2-211ENST00000588374 MT3P25713 68 aa2.19□□□□□ -2.06
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.19□□□□□ -2.06
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFAF8A1L188 74 aa2.15□□□□□ -2.07
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP12-4P60329 112 aa2.11□□□□□ -2.07
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.09□□□□□ -2.07
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.08□□□□□ -2.08
EFTUD2-211ENST00000588374 MT1AP04731 61 aa2.05□□□□□ -2.08
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.05□□□□□ -2.08
EFTUD2-211ENST00000588374 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.04□□□□□ -2.08
EFTUD2-211ENST00000588374 LUZP6Q538Z0 58 aa2.04□□□□□ -2.08
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.01□□□□□ -2.09
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.95□□□□□ -2.1
EFTUD2-211ENST00000588374 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.93□□□□□ -2.1
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.91□□□□□ -2.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.89□□□□□ -2.11
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-8O75690 187 aa1.87□□□□□ -2.11
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE1FQ5T754 118 aa1.85□□□□□ -2.11
EFTUD2-211ENST00000588374 INE1O15225 51 aa1.76□□□□□ -2.13
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE1CQ5T751 118 aa1.71□□□□□ -2.14
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.71□□□□□ -2.14
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.64□□□□□ -2.15
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.63□□□□□ -2.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC5ACP98088 5654 aa1.57□□□□□ -2.16
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.17
EFTUD2-211ENST00000588374 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.42□□□□□ -2.18
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.35□□□□□ -2.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PRM1P04553 51 aa1.3□□□□□ -2.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PHGR1C9JFL3 82 aa1.22□□□□□ -2.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.88□□□□□ -2.27
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms