RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583658.1

LLGL2-222, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM258	P61165	79 aa		6.59	□□□□□ -1.35
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.58	□□□□□ -1.36
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.53	□□□□□ -1.36
LLGL2-222	ENST00000583658	UQCR11	O14957	56 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LLGL2-222	ENST00000583658	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.49	□□□□□ -1.37
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LLGL2-222	ENST00000583658	MT4	P47944	62 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LLGL2-222	ENST00000583658	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LLGL2-222	ENST00000583658	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LLGL2-222	ENST00000583658		K7ERS5	55 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LLGL2-222	ENST00000583658	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LLGL2-222	ENST00000583658		V9GYY9	64 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.15	□□□□□ -1.42
LLGL2-222	ENST00000583658		Q1T7F1	81 aa		6.14	□□□□□ -1.43
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
LLGL2-222	ENST00000583658	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LLGL2-222	ENST00000583658	PSPHP1	O15172	72 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LLGL2-222	ENST00000583658	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6	□□□□□ -1.45
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LLGL2-222	ENST00000583658		A6NED7	52 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LLGL2-222	ENST00000583658	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.91	□□□□□ -1.46
LLGL2-222	ENST00000583658	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LLGL2-222	ENST00000583658	ROMO1	P60602	79 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LLGL2-222	ENST00000583658	MT1A	P04731	61 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LLGL2-222	ENST00000583658	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.63	□□□□□ -1.51
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.62	□□□□□ -1.51
LLGL2-222	ENST00000583658	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.57	□□□□□ -1.52
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.54	□□□□□ -1.52
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.53	□□□□□ -1.52
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.51	□□□□□ -1.53
LLGL2-222	ENST00000583658	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.44	□□□□□ -1.54
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.39	□□□□□ -1.55
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LLGL2-222	ENST00000583658	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LLGL2-222	ENST00000583658	MT3	P25713	68 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LLGL2-222	ENST00000583658	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
LLGL2-222	ENST00000583658	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
LLGL2-222	ENST00000583658	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LLGL2-222	ENST00000583658	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LLGL2-222	ENST00000583658	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LLGL2-222	ENST00000583658	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LLGL2-222	ENST00000583658		H3BS24	57 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LLGL2-222	ENST00000583658	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LLGL2-222	ENST00000583658	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4	□□□□□ -1.77
LLGL2-222	ENST00000583658	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.91	□□□□□ -1.78
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LLGL2-222	ENST00000583658	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LLGL2-222	ENST00000583658		A0A0A0MQY5	61 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LLGL2-222	ENST00000583658	INE1	O15225	51 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LLGL2-222	ENST00000583658	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LLGL2-222	ENST00000583658	PRM1	P04553	51 aa		2.92	□□□□□ -1.94
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LLGL2-222	ENST00000583658	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.3	□□□□□ -2.04

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