RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1B0GV90 55 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MT1MQ8N339 61 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNURFQ9Y675 71 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.32□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MT1LQ93083 61 aa3.32□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.32□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.31□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SEC61GP60059 68 aa3.31□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.31□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.3□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.29□□□□□ -1.88
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP12-1P59990 96 aa3.26□□□□□ -1.89
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1B0GU33 70 aa3.25□□□□□ -1.89
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COA5Q86WW8 74 aa3.25□□□□□ -1.89
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.23□□□□□ -1.89
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.23□□□□□ -1.89
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.22□□□□□ -1.89
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE3AQ5TA76 89 aa3.21□□□□□ -1.9
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SERP2Q8N6R1 65 aa3.2□□□□□ -1.9
SRP54-AS1-201ENST00000554945 K7ERU9 68 aa3.19□□□□□ -1.9
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNP1P09430 55 aa3.19□□□□□ -1.9
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.17□□□□□ -1.9
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.14□□□□□ -1.91
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.12□□□□□ -1.91
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A8MU10 97 aa3.12□□□□□ -1.91
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1B0GU69 56 aa3.1□□□□□ -1.91
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP12-3P60328 96 aa3.1□□□□□ -1.91
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP12-4P60329 112 aa3.08□□□□□ -1.92
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE1FQ5T754 118 aa3.05□□□□□ -1.92
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H7BZZ5 65 aa3.04□□□□□ -1.92
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COX7CP15954 63 aa3.04□□□□□ -1.92
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRR15LQ9BU68 103 aa2.96□□□□□ -1.94
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.93□□□□□ -1.94
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.91□□□□□ -1.94
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRAC1Q96KF2 57 aa2.88□□□□□ -1.95
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.88□□□□□ -1.95
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NDUFAF8A1L188 74 aa2.86□□□□□ -1.95
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UQCR11O14957 56 aa2.86□□□□□ -1.95
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP5-8O75690 187 aa2.82□□□□□ -1.96
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MT1AP04731 61 aa2.82□□□□□ -1.96
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.81□□□□□ -1.96
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.81□□□□□ -1.96
SRP54-AS1-201ENST00000554945 K7ERS5 55 aa2.77□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MUC5ACP98088 5654 aa2.77□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC179H3BU77 68 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.73□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.67□□□□□ -1.98
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM258P61165 79 aa2.65□□□□□ -1.99
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE1CQ5T751 118 aa2.59□□□□□ -1.99
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.59□□□□□ -1.99
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PSPHP1O15172 72 aa2.58□□□□□ -2
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q1T7F1 81 aa2.58□□□□□ -2
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.58□□□□□ -2
SRP54-AS1-201ENST00000554945 V9GYY9 64 aa2.58□□□□□ -2
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ROMO1P60602 79 aa2.52□□□□□ -2.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A6NED7 52 aa2.49□□□□□ -2.01
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.3□□□□□ -2.04
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRO0628Q9UI54 55 aa2.08□□□□□ -2.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.03□□□□□ -2.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LUZP6Q538Z0 58 aa1.98□□□□□ -2.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PHGR1C9JFL3 82 aa1.95□□□□□ -2.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.91□□□□□ -2.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BRK1Q8WUW1 75 aa1.87□□□□□ -2.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PMAIP1Q13794 54 aa1.82□□□□□ -2.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.53□□□□□ -2.16
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.49□□□□□ -2.17
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRM1P04553 51 aa1.27□□□□□ -2.21
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INE1O15225 51 aa1.26□□□□□ -2.21
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms