RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.01□□□□□ -1.61
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5□□□□□ -1.61
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MT1GP13640 62 aa4.98□□□□□ -1.61
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.97□□□□□ -1.61
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRR15LQ9BU68 103 aa4.96□□□□□ -1.62
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A8MU10 97 aa4.94□□□□□ -1.62
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TNP1P09430 55 aa4.94□□□□□ -1.62
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.93□□□□□ -1.62
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC179H3BU77 68 aa4.87□□□□□ -1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MT1MQ8N339 61 aa4.85□□□□□ -1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.85□□□□□ -1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE3AQ5TA76 89 aa4.84□□□□□ -1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MT1LQ93083 61 aa4.84□□□□□ -1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MT4P47944 62 aa4.79□□□□□ -1.64
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.79□□□□□ -1.64
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.76□□□□□ -1.65
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UQCR11O14957 56 aa4.75□□□□□ -1.65
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.73□□□□□ -1.65
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.71□□□□□ -1.66
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP12-3P60328 96 aa4.7□□□□□ -1.66
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TMEM258P61165 79 aa4.68□□□□□ -1.66
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 K7ERS5 55 aa4.66□□□□□ -1.66
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRO0628Q9UI54 55 aa4.66□□□□□ -1.66
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.64□□□□□ -1.67
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.61□□□□□ -1.67
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.61□□□□□ -1.67
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRAC1Q96KF2 57 aa4.56□□□□□ -1.68
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.51□□□□□ -1.69
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PMAIP1Q13794 54 aa4.5□□□□□ -1.69
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.48□□□□□ -1.69
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PSPHP1O15172 72 aa4.47□□□□□ -1.69
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP12-4P60329 112 aa4.47□□□□□ -1.69
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.42□□□□□ -1.7
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.41□□□□□ -1.7
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 Q1T7F1 81 aa4.38□□□□□ -1.71
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A6NED7 52 aa4.35□□□□□ -1.71
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.33□□□□□ -1.72
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.33□□□□□ -1.72
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.31□□□□□ -1.72
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ROMO1P60602 79 aa4.22□□□□□ -1.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MT1AP04731 61 aa4.14□□□□□ -1.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.12□□□□□ -1.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.11□□□□□ -1.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.09□□□□□ -1.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.04□□□□□ -1.76
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LUZP6Q538Z0 58 aa4.03□□□□□ -1.76
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE1EQ5T753 118 aa3.97□□□□□ -1.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.96□□□□□ -1.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.96□□□□□ -1.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NDUFAF8A1L188 74 aa3.95□□□□□ -1.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BRK1Q8WUW1 75 aa3.93□□□□□ -1.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-8O75690 187 aa3.89□□□□□ -1.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.85□□□□□ -1.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MT3P25713 68 aa3.84□□□□□ -1.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MUC5ACP98088 5654 aa3.77□□□□□ -1.81
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.67□□□□□ -1.82
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.5□□□□□ -1.85
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.36□□□□□ -1.87
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE1CQ5T751 118 aa3.25□□□□□ -1.89
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE1FQ5T754 118 aa3.14□□□□□ -1.91
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.12□□□□□ -1.91
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 INE1O15225 51 aa3.02□□□□□ -1.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.91□□□□□ -1.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.68□□□□□ -1.98
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PHGR1C9JFL3 82 aa2.67□□□□□ -1.98
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.37□□□□□ -2.03
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRM1P04553 51 aa2.13□□□□□ -2.07
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.04□□□□□ -2.08
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 237.1 ms