RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 KRTAP10-12P60413 245 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-233ENST00000552688 PRR15LQ9BU68 103 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-233ENST00000552688 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-233ENST00000552688 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-233ENST00000552688 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
CS-233ENST00000552688 LCE4AQ5TA78 99 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-233ENST00000552688 KRTAP12-1P59990 96 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-233ENST00000552688 Q1T7F1 81 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-233ENST00000552688 BRK1Q8WUW1 75 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-233ENST00000552688 UQCR11O14957 56 aa2.63□□□□□ -1.99
CS-233ENST00000552688 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-233ENST00000552688 MT3P25713 68 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-233ENST00000552688 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-233ENST00000552688 LCE1DQ5T752 114 aa2.57□□□□□ -2
CS-233ENST00000552688 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.57□□□□□ -2
CS-233ENST00000552688 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.56□□□□□ -2
CS-233ENST00000552688 MT1EP04732 61 aa2.55□□□□□ -2
CS-233ENST00000552688 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.54□□□□□ -2
CS-233ENST00000552688 MT1GP13640 62 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 MT4P47944 62 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 PP632Q6XCG6 107 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 TNP1P09430 55 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 LCE3AQ5TA76 89 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.46□□□□□ -2.02
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-233ENST00000552688 MT1MQ8N339 61 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-233ENST00000552688 MT1LQ93083 61 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-233ENST00000552688 ROMO1P60602 79 aa2.4□□□□□ -2.03
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.4□□□□□ -2.03
CS-233ENST00000552688 KRTAP12-3P60328 96 aa2.37□□□□□ -2.03
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-233ENST00000552688 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-233ENST00000552688 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.32□□□□□ -2.04
CS-233ENST00000552688 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.32□□□□□ -2.04
CS-233ENST00000552688 LCE1FQ5T754 118 aa2.32□□□□□ -2.04
CS-233ENST00000552688 KRTAP12-4P60329 112 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-233ENST00000552688 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CS-233ENST00000552688 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.11□□□□□ -2.07
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-8O75690 187 aa2.1□□□□□ -2.07
CS-233ENST00000552688 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-233ENST00000552688 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
CS-233ENST00000552688 INE1O15225 51 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-233ENST00000552688 MT1AP04731 61 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-233ENST00000552688 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-233ENST00000552688 MUC5ACP98088 5654 aa1.99□□□□□ -2.09
CS-233ENST00000552688 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.98□□□□□ -2.09
CS-233ENST00000552688 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.95□□□□□ -2.1
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.95□□□□□ -2.1
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.93□□□□□ -2.1
CS-233ENST00000552688 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
CS-233ENST00000552688 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
CS-233ENST00000552688 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-233ENST00000552688 LCE1EQ5T753 118 aa1.81□□□□□ -2.12
CS-233ENST00000552688 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.76□□□□□ -2.13
CS-233ENST00000552688 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.68□□□□□ -2.14
CS-233ENST00000552688 LCE1CQ5T751 118 aa1.67□□□□□ -2.14
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.54□□□□□ -2.16
CS-233ENST00000552688 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
CS-233ENST00000552688 PHGR1C9JFL3 82 aa1.47□□□□□ -2.17
CS-233ENST00000552688 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.35□□□□□ -2.19
CS-233ENST00000552688 PRM1P04553 51 aa1.27□□□□□ -2.21
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.26□□□□□ -2.21
CS-233ENST00000552688 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.14□□□□□ -2.23
CS-233ENST00000552688 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.14□□□□□ -2.23
CS-233ENST00000552688 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.86□□□□□ -2.27
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