RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544432.5

VAMP1-208, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, human

TSL 3

Gene VAMP1, Length 759 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP1-208	ENST00000544432	TNP1	P09430	55 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAMP1-208	ENST00000544432	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAMP1-208	ENST00000544432	PCP4	P48539	62 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAMP1-208	ENST00000544432	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAMP1-208	ENST00000544432	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAMP1-208	ENST00000544432	UQCR11	O14957	56 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAMP1-208	ENST00000544432	MT1L	Q93083	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAMP1-208	ENST00000544432	MT1M	Q8N339	61 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAMP1-208	ENST00000544432	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VAMP1-208	ENST00000544432		V9GYY9	64 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VAMP1-208	ENST00000544432		K7ERS5	55 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VAMP1-208	ENST00000544432		Q1T7F1	81 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VAMP1-208	ENST00000544432	PSPHP1	O15172	72 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VAMP1-208	ENST00000544432	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VAMP1-208	ENST00000544432	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VAMP1-208	ENST00000544432	MT4	P47944	62 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VAMP1-208	ENST00000544432		A6NED7	52 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VAMP1-208	ENST00000544432	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VAMP1-208	ENST00000544432	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAMP1-208	ENST00000544432	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAMP1-208	ENST00000544432	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAMP1-208	ENST00000544432	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.45	□□□□□ -1.7
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.44	□□□□□ -1.7
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.44	□□□□□ -1.7
VAMP1-208	ENST00000544432	ROMO1	P60602	79 aa		4.43	□□□□□ -1.7
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.43	□□□□□ -1.7
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.42	□□□□□ -1.7
VAMP1-208	ENST00000544432	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.33	□□□□□ -1.72
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VAMP1-208	ENST00000544432	MT1A	P04731	61 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
VAMP1-208	ENST00000544432	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.99	□□□□□ -1.77
VAMP1-208	ENST00000544432	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.98	□□□□□ -1.77
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VAMP1-208	ENST00000544432	MT3	P25713	68 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VAMP1-208	ENST00000544432	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VAMP1-208	ENST00000544432		A0A0A0MQY5	61 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VAMP1-208	ENST00000544432	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VAMP1-208	ENST00000544432	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VAMP1-208	ENST00000544432	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VAMP1-208	ENST00000544432	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
VAMP1-208	ENST00000544432	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.71	□□□□□ -1.82
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.7	□□□□□ -1.82
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VAMP1-208	ENST00000544432	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.25	□□□□□ -1.89
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VAMP1-208	ENST00000544432	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VAMP1-208	ENST00000544432	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAMP1-208	ENST00000544432	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3	□□□□□ -1.93
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VAMP1-208	ENST00000544432	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.58	□□□□□ -2
VAMP1-208	ENST00000544432	INE1	O15225	51 aa		2.52	□□□□□ -2.01
VAMP1-208	ENST00000544432	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.34	□□□□□ -2.03
VAMP1-208	ENST00000544432	PRM1	P04553	51 aa		2.25	□□□□□ -2.05
VAMP1-208	ENST00000544432	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.97	□□□□□ -2.09
VAMP1-208	ENST00000544432	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.75	□□□□□ -2.13

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