RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541852.5

ITM2C-208, Transcript of integral membrane protein 2C, human

TSL 3

Gene ITM2C, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITM2C-208	ENST00000541852	TMEM258	P61165	79 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ITM2C-208	ENST00000541852	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ITM2C-208	ENST00000541852		A0A1B0GU69	56 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ITM2C-208	ENST00000541852	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ITM2C-208	ENST00000541852		H3BS24	57 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ITM2C-208	ENST00000541852		A8MU10	97 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5	□□□□□ -1.61
ITM2C-208	ENST00000541852	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5	□□□□□ -1.61
ITM2C-208	ENST00000541852	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITM2C-208	ENST00000541852	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITM2C-208	ENST00000541852	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITM2C-208	ENST00000541852		V9GYY9	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITM2C-208	ENST00000541852		Q1T7F1	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITM2C-208	ENST00000541852	UQCR11	O14957	56 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ITM2C-208	ENST00000541852	PSPHP1	O15172	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ITM2C-208	ENST00000541852	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ITM2C-208	ENST00000541852	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ITM2C-208	ENST00000541852	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ITM2C-208	ENST00000541852		K7ERS5	55 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ITM2C-208	ENST00000541852		A6NED7	52 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITM2C-208	ENST00000541852	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ITM2C-208	ENST00000541852	MT1A	P04731	61 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ITM2C-208	ENST00000541852	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ITM2C-208	ENST00000541852	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ITM2C-208	ENST00000541852	ROMO1	P60602	79 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ITM2C-208	ENST00000541852	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ITM2C-208	ENST00000541852	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ITM2C-208	ENST00000541852	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ITM2C-208	ENST00000541852	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ITM2C-208	ENST00000541852		A0A0A0MQY5	61 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ITM2C-208	ENST00000541852	MT3	P25713	68 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ITM2C-208	ENST00000541852	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ITM2C-208	ENST00000541852	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ITM2C-208	ENST00000541852	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
ITM2C-208	ENST00000541852	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.24	□□□□□ -1.89
ITM2C-208	ENST00000541852	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ITM2C-208	ENST00000541852	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ITM2C-208	ENST00000541852	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ITM2C-208	ENST00000541852	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ITM2C-208	ENST00000541852	INE1	O15225	51 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ITM2C-208	ENST00000541852	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.33	□□□□□ -2.04
ITM2C-208	ENST00000541852	PRM1	P04553	51 aa		2.22	□□□□□ -2.05
ITM2C-208	ENST00000541852	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.93	□□□□□ -2.1

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