RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537248.5

ZNF384-208, Transcript of zinc finger protein 384, human

TSL 2

Gene ZNF384, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ZNF384-208	ENST00000537248	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ZNF384-208	ENST00000537248	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ZNF384-208	ENST00000537248	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ZNF384-208	ENST00000537248	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF384-208	ENST00000537248	TNP1	P09430	55 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF384-208	ENST00000537248		A0A1B0GU33	70 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ZNF384-208	ENST00000537248	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ZNF384-208	ENST00000537248	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.63	□□□□□ -1.51
ZNF384-208	ENST00000537248		H3BS24	57 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ZNF384-208	ENST00000537248	SEC61G	P60059	68 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ZNF384-208	ENST00000537248	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ZNF384-208	ENST00000537248	COX7C	P15954	63 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ZNF384-208	ENST00000537248	SNURF	Q9Y675	71 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ZNF384-208	ENST00000537248	SERP2	Q8N6R1	65 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ZNF384-208	ENST00000537248	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ZNF384-208	ENST00000537248	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ZNF384-208	ENST00000537248	COA5	Q86WW8	74 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM258	P61165	79 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ZNF384-208	ENST00000537248		A8MU10	97 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ZNF384-208	ENST00000537248	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ZNF384-208	ENST00000537248	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ZNF384-208	ENST00000537248	MT1A	P04731	61 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ZNF384-208	ENST00000537248	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ZNF384-208	ENST00000537248		H7BZZ5	65 aa		5.32	□□□□□ -1.56
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.32	□□□□□ -1.56
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.32	□□□□□ -1.56
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.28	□□□□□ -1.56
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZNF384-208	ENST00000537248		A0A1B0GU69	56 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZNF384-208	ENST00000537248	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ZNF384-208	ENST00000537248		A0A0A0MQY5	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ZNF384-208	ENST00000537248		V9GYY9	64 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF384-208	ENST00000537248		Q1T7F1	81 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF384-208	ENST00000537248	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZNF384-208	ENST00000537248	MT3	P25713	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF384-208	ENST00000537248	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZNF384-208	ENST00000537248	PSPHP1	O15172	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF384-208	ENST00000537248	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZNF384-208	ENST00000537248	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF384-208	ENST00000537248		A6NED7	52 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF384-208	ENST00000537248	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF384-208	ENST00000537248	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF384-208	ENST00000537248	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF384-208	ENST00000537248	UQCR11	O14957	56 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ZNF384-208	ENST00000537248	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF384-208	ENST00000537248	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF384-208	ENST00000537248		K7ERS5	55 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ZNF384-208	ENST00000537248	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ZNF384-208	ENST00000537248	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ZNF384-208	ENST00000537248	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ZNF384-208	ENST00000537248	ROMO1	P60602	79 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ZNF384-208	ENST00000537248	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF384-208	ENST00000537248	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ZNF384-208	ENST00000537248	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF384-208	ENST00000537248	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ZNF384-208	ENST00000537248	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ZNF384-208	ENST00000537248	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ZNF384-208	ENST00000537248	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ZNF384-208	ENST00000537248	INE1	O15225	51 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ZNF384-208	ENST00000537248	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ZNF384-208	ENST00000537248	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.46	□□□□□ -2.02
ZNF384-208	ENST00000537248	PRM1	P04553	51 aa		2.17	□□□□□ -2.06

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