RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CTSB-231	ENST00000534382	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CTSB-231	ENST00000534382	MT1E	P04732	61 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CTSB-231	ENST00000534382	TNP1	P09430	55 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CTSB-231	ENST00000534382		V9GYY9	64 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CTSB-231	ENST00000534382	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CTSB-231	ENST00000534382		Q1T7F1	81 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CTSB-231	ENST00000534382	PSPHP1	O15172	72 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CTSB-231	ENST00000534382	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CTSB-231	ENST00000534382		K7ERS5	55 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CTSB-231	ENST00000534382	MT1G	P13640	62 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CTSB-231	ENST00000534382	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CTSB-231	ENST00000534382	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CTSB-231	ENST00000534382	MT1L	Q93083	61 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CTSB-231	ENST00000534382	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CTSB-231	ENST00000534382		A6NED7	52 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CTSB-231	ENST00000534382	MT1M	Q8N339	61 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5	□□□□□ -1.61
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTSB-231	ENST00000534382	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSB-231	ENST00000534382	ROMO1	P60602	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTSB-231	ENST00000534382	MT4	P47944	62 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTSB-231	ENST00000534382	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTSB-231	ENST00000534382	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTSB-231	ENST00000534382	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CTSB-231	ENST00000534382	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CTSB-231	ENST00000534382	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSB-231	ENST00000534382	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSB-231	ENST00000534382	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CTSB-231	ENST00000534382	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CTSB-231	ENST00000534382	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CTSB-231	ENST00000534382	MT1A	P04731	61 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CTSB-231	ENST00000534382	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CTSB-231	ENST00000534382	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTSB-231	ENST00000534382		A0A0A0MQY5	61 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSB-231	ENST00000534382	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSB-231	ENST00000534382	MT3	P25713	68 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CTSB-231	ENST00000534382	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CTSB-231	ENST00000534382	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSB-231	ENST00000534382	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CTSB-231	ENST00000534382	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CTSB-231	ENST00000534382	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CTSB-231	ENST00000534382	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CTSB-231	ENST00000534382	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CTSB-231	ENST00000534382	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CTSB-231	ENST00000534382	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CTSB-231	ENST00000534382	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CTSB-231	ENST00000534382	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CTSB-231	ENST00000534382	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.24	□□□□□ -1.89
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.88	□□□□□ -1.95
CTSB-231	ENST00000534382	INE1	O15225	51 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CTSB-231	ENST00000534382	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CTSB-231	ENST00000534382	PRM1	P04553	51 aa		2.49	□□□□□ -2.01
CTSB-231	ENST00000534382	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.41	□□□□□ -2.02
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.96	□□□□□ -2.1
CTSB-231	ENST00000534382	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.75	□□□□□ -2.13

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