RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNP1P09430 55 aa2.97□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT1AP04731 61 aa2.96□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRO0461Q9UI25 63 aa2.96□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 V9GYY9 64 aa2.96□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.95□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCGB1A1P11684 91 aa2.94□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP12-1P59990 96 aa2.94□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OCR1Q9BZK8 76 aa2.94□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F8W1H4 67 aa2.92□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BS24 57 aa2.92□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3QR89 54 aa2.91□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7ERU9 68 aa2.9□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BPC8 53 aa2.88□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ETDBQ3ZM63 59 aa2.87□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa2.87□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0A0MQY5 61 aa2.83□□□□□ -1.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRO0628Q9UI54 55 aa2.79□□□□□ -1.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.77□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GU33 70 aa2.75□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.75□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT3P25713 68 aa2.75□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.75□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.75□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00643Q86TS7 51 aa2.74□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.73□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MU10 97 aa2.72□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.69□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.68□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMAIP1Q13794 54 aa2.67□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.66□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.66□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.65□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.65□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.65□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.62□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE1EQ5T753 118 aa2.62□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERP2Q8N6R1 65 aa2.6□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX7CP15954 63 aa2.59□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC179H3BU77 68 aa2.58□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSPHP1O15172 72 aa2.56□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNURFQ9Y675 71 aa2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COA5Q86WW8 74 aa2.53□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHGR1C9JFL3 82 aa2.52□□□□□ -2.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM258P61165 79 aa2.51□□□□□ -2.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.5□□□□□ -2.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.49□□□□□ -2.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRK1Q8WUW1 75 aa2.49□□□□□ -2.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H7BZZ5 65 aa2.45□□□□□ -2.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE1CQ5T751 118 aa2.45□□□□□ -2.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GU69 56 aa2.43□□□□□ -2.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.41□□□□□ -2.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7ERS5 55 aa2.4□□□□□ -2.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAC1Q96KF2 57 aa2.38□□□□□ -2.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE1FQ5T754 118 aa2.32□□□□□ -2.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q1T7F1 81 aa2.31□□□□□ -2.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR15LQ9BU68 103 aa2.31□□□□□ -2.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LUZP6Q538Z0 58 aa2.3□□□□□ -2.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A6NED7 52 aa2.29□□□□□ -2.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.27□□□□□ -2.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UQCR11O14957 56 aa2.2□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.18□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFAF8A1L188 74 aa2.17□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROMO1P60602 79 aa2.17□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.17□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.08□□□□□ -2.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.01□□□□□ -2.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.98□□□□□ -2.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.88□□□□□ -2.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INE1O15225 51 aa1.85□□□□□ -2.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.85□□□□□ -2.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.63□□□□□ -2.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.35□□□□□ -2.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRM1P04553 51 aa1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 284.3 ms