RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		8.13	□□□□□ -1.11
PUF60-222	ENST00000533362	ROMO1	P60602	79 aa		8.11	□□□□□ -1.11
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		8.07	□□□□□ -1.12
PUF60-222	ENST00000533362	MT1G	P13640	62 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP12-3	P60328	96 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PUF60-222	ENST00000533362	PP632	Q6XCG6	107 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PUF60-222	ENST00000533362	LCE3B	Q5TA77	95 aa		8.02	□□□□□ -1.13
PUF60-222	ENST00000533362	MT1L	Q93083	61 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		8.01	□□□□□ -1.13
PUF60-222	ENST00000533362	MT1M	Q8N339	61 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PUF60-222	ENST00000533362	BRK1	Q8WUW1	75 aa		7.89	□□□□□ -1.15
PUF60-222	ENST00000533362	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PUF60-222	ENST00000533362	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PUF60-222	ENST00000533362	PMAIP1	Q13794	54 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PUF60-222	ENST00000533362	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PUF60-222	ENST00000533362	PRO0628	Q9UI54	55 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PUF60-222	ENST00000533362	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PUF60-222	ENST00000533362	MT4	P47944	62 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
PUF60-222	ENST00000533362	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PUF60-222	ENST00000533362	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PUF60-222	ENST00000533362	PRAC1	Q96KF2	57 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PUF60-222	ENST00000533362	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.9	□□□□□ -1.3
PUF60-222	ENST00000533362	MT1A	P04731	61 aa		6.86	□□□□□ -1.31
PUF60-222	ENST00000533362	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		6.86	□□□□□ -1.31
PUF60-222	ENST00000533362	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.83	□□□□□ -1.32
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.83	□□□□□ -1.32
PUF60-222	ENST00000533362	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.76	□□□□□ -1.33
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PUF60-222	ENST00000533362	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.71	□□□□□ -1.34
PUF60-222	ENST00000533362	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.44	□□□□□ -1.38
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.37	□□□□□ -1.39
PUF60-222	ENST00000533362	MT3	P25713	68 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PUF60-222	ENST00000533362	LUZP6	Q538Z0	58 aa		6	□□□□□ -1.45
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PUF60-222	ENST00000533362	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PUF60-222	ENST00000533362	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUF60-222	ENST00000533362	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PUF60-222	ENST00000533362	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PUF60-222	ENST00000533362	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PUF60-222	ENST00000533362	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PUF60-222	ENST00000533362	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PUF60-222	ENST00000533362	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PUF60-222	ENST00000533362	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PUF60-222	ENST00000533362	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUF60-222	ENST00000533362		H3BS24	57 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUF60-222	ENST00000533362	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PUF60-222	ENST00000533362		A0A0A0MQY5	61 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PUF60-222	ENST00000533362	INE1	O15225	51 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PUF60-222	ENST00000533362	PRM1	P04553	51 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF60-222	ENST00000533362	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.95	□□□□□ -1.78
PUF60-222	ENST00000533362	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PUF60-222	ENST00000533362	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.56	□□□□□ -2

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