RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513420.1

CTBP1-212, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 3

Gene CTBP1, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-212	ENST00000513420	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CTBP1-212	ENST00000513420	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CTBP1-212	ENST00000513420	MT1E	P04732	61 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ROMO1	P60602	79 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CTBP1-212	ENST00000513420	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MT1G	P13640	62 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CTBP1-212	ENST00000513420	MT1M	Q8N339	61 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CTBP1-212	ENST00000513420	MT4	P47944	62 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CTBP1-212	ENST00000513420	MT1L	Q93083	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CTBP1-212	ENST00000513420	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CTBP1-212	ENST00000513420	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CTBP1-212	ENST00000513420	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CTBP1-212	ENST00000513420	TNP1	P09430	55 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP1-212	ENST00000513420		H3BS24	57 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTBP1-212	ENST00000513420	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTBP1-212	ENST00000513420	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTBP1-212	ENST00000513420	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTBP1-212	ENST00000513420	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CTBP1-212	ENST00000513420	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTBP1-212	ENST00000513420	MT1A	P04731	61 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CTBP1-212	ENST00000513420		A0A0A0MQY5	61 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CTBP1-212	ENST00000513420	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CTBP1-212	ENST00000513420	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CTBP1-212	ENST00000513420	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CTBP1-212	ENST00000513420	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTBP1-212	ENST00000513420	MT3	P25713	68 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTBP1-212	ENST00000513420	INE1	O15225	51 aa		4	□□□□□ -1.77
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.27	□□□□□ -1.89
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CTBP1-212	ENST00000513420	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CTBP1-212	ENST00000513420	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.89	□□□□□ -1.95
CTBP1-212	ENST00000513420	PRM1	P04553	51 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CTBP1-212	ENST00000513420	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CTBP1-212	ENST00000513420	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.85	□□□□□ -2.11

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