RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.96□□□□□ -1.3
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.96□□□□□ -1.3
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.96□□□□□ -1.3
PITX1-204ENST00000504936 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PITX1-204ENST00000504936 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.9□□□□□ -1.3
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.84□□□□□ -1.31
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.83□□□□□ -1.32
PITX1-204ENST00000504936 PP632Q6XCG6 107 aa6.82□□□□□ -1.32
PITX1-204ENST00000504936 MT1GP13640 62 aa6.8□□□□□ -1.32
PITX1-204ENST00000504936 MT1LQ93083 61 aa6.78□□□□□ -1.32
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP12-3P60328 96 aa6.74□□□□□ -1.33
PITX1-204ENST00000504936 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PITX1-204ENST00000504936 MT1MQ8N339 61 aa6.71□□□□□ -1.34
PITX1-204ENST00000504936 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.71□□□□□ -1.34
PITX1-204ENST00000504936 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.62□□□□□ -1.35
PITX1-204ENST00000504936 ROMO1P60602 79 aa6.58□□□□□ -1.36
PITX1-204ENST00000504936 SVIPQ8NHG7 77 aa6.55□□□□□ -1.36
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.55□□□□□ -1.36
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.55□□□□□ -1.36
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.54□□□□□ -1.36
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.48□□□□□ -1.37
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.43□□□□□ -1.38
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.36□□□□□ -1.39
PITX1-204ENST00000504936 LCE4AQ5TA78 99 aa6.33□□□□□ -1.4
PITX1-204ENST00000504936 MT4P47944 62 aa6.3□□□□□ -1.4
PITX1-204ENST00000504936 LCE1DQ5T752 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PITX1-204ENST00000504936 BRK1Q8WUW1 75 aa6.28□□□□□ -1.4
PITX1-204ENST00000504936 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.2□□□□□ -1.42
PITX1-204ENST00000504936 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.19□□□□□ -1.42
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.18□□□□□ -1.42
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.12□□□□□ -1.43
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.12□□□□□ -1.43
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PITX1-204ENST00000504936 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.02□□□□□ -1.45
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP12-4P60329 112 aa5.95□□□□□ -1.46
PITX1-204ENST00000504936 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.89□□□□□ -1.47
PITX1-204ENST00000504936 PMAIP1Q13794 54 aa5.87□□□□□ -1.47
PITX1-204ENST00000504936 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.85□□□□□ -1.47
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.84□□□□□ -1.47
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.8□□□□□ -1.48
PITX1-204ENST00000504936 MT1AP04731 61 aa5.77□□□□□ -1.49
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.74□□□□□ -1.49
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.66□□□□□ -1.5
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.65□□□□□ -1.5
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PITX1-204ENST00000504936 PRO0628Q9UI54 55 aa5.6□□□□□ -1.51
PITX1-204ENST00000504936 A0A0A0MQY5 61 aa5.58□□□□□ -1.52
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.57□□□□□ -1.52
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.46□□□□□ -1.54
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.45□□□□□ -1.54
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.44□□□□□ -1.54
PITX1-204ENST00000504936 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.32□□□□□ -1.56
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PITX1-204ENST00000504936 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.14□□□□□ -1.59
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-8O75690 187 aa5.1□□□□□ -1.59
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PITX1-204ENST00000504936 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.86□□□□□ -1.63
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PITX1-204ENST00000504936 LCE1EQ5T753 118 aa4.73□□□□□ -1.65
PITX1-204ENST00000504936 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.57□□□□□ -1.68
PITX1-204ENST00000504936 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.54□□□□□ -1.68
PITX1-204ENST00000504936 NDUFAF8A1L188 74 aa4.4□□□□□ -1.71
PITX1-204ENST00000504936 LCE1CQ5T751 118 aa4.4□□□□□ -1.71
PITX1-204ENST00000504936 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.31□□□□□ -1.72
PITX1-204ENST00000504936 LCE1FQ5T754 118 aa4.13□□□□□ -1.75
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.98□□□□□ -1.77
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.73□□□□□ -1.81
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.47□□□□□ -1.85
PITX1-204ENST00000504936 PHGR1C9JFL3 82 aa3.46□□□□□ -1.86
PITX1-204ENST00000504936 PRM1P04553 51 aa3.4□□□□□ -1.87
PITX1-204ENST00000504936 INE1O15225 51 aa3.23□□□□□ -1.89
PITX1-204ENST00000504936 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.17□□□□□ -1.9
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.6□□□□□ -1.99
PITX1-204ENST00000504936 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.29□□□□□ -2.04
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