RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 PP632Q6XCG6 107 aa8.32□□□□□ -1.08
PITX1-202ENST00000502676 PCP4P48539 62 aa8.3□□□□□ -1.08
PITX1-202ENST00000502676 MT1LQ93083 61 aa8.3□□□□□ -1.08
PITX1-202ENST00000502676 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PITX1-202ENST00000502676 A6NED7 52 aa8.26□□□□□ -1.09
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.23□□□□□ -1.09
PITX1-202ENST00000502676 MT1MQ8N339 61 aa8.22□□□□□ -1.09
PITX1-202ENST00000502676 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP12-3P60328 96 aa8.17□□□□□ -1.1
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.02□□□□□ -1.13
PITX1-202ENST00000502676 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.97□□□□□ -1.13
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.94□□□□□ -1.14
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.91□□□□□ -1.14
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.91□□□□□ -1.14
PITX1-202ENST00000502676 ROMO1P60602 79 aa7.84□□□□□ -1.15
PITX1-202ENST00000502676 LCE4AQ5TA78 99 aa7.83□□□□□ -1.16
PITX1-202ENST00000502676 LCE1DQ5T752 114 aa7.77□□□□□ -1.17
PITX1-202ENST00000502676 MT4P47944 62 aa7.74□□□□□ -1.17
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.71□□□□□ -1.18
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.7□□□□□ -1.18
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.69□□□□□ -1.18
PITX1-202ENST00000502676 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.64□□□□□ -1.19
PITX1-202ENST00000502676 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.54□□□□□ -1.2
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.51□□□□□ -1.21
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PITX1-202ENST00000502676 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.48□□□□□ -1.21
PITX1-202ENST00000502676 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.48□□□□□ -1.21
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP12-4P60329 112 aa7.31□□□□□ -1.24
PITX1-202ENST00000502676 BRK1Q8WUW1 75 aa7.29□□□□□ -1.24
PITX1-202ENST00000502676 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.28□□□□□ -1.24
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.27□□□□□ -1.25
PITX1-202ENST00000502676 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.25□□□□□ -1.25
PITX1-202ENST00000502676 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.09□□□□□ -1.27
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.08□□□□□ -1.28
PITX1-202ENST00000502676 MT1AP04731 61 aa7.07□□□□□ -1.28
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.02□□□□□ -1.29
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.02□□□□□ -1.29
PITX1-202ENST00000502676 PMAIP1Q13794 54 aa6.86□□□□□ -1.31
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.81□□□□□ -1.32
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.79□□□□□ -1.32
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.77□□□□□ -1.33
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.67□□□□□ -1.34
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.59□□□□□ -1.35
PITX1-202ENST00000502676 PRAC1Q96KF2 57 aa6.56□□□□□ -1.36
PITX1-202ENST00000502676 MT3P25713 68 aa6.47□□□□□ -1.37
PITX1-202ENST00000502676 PRO0628Q9UI54 55 aa6.45□□□□□ -1.38
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-8O75690 187 aa6.34□□□□□ -1.39
PITX1-202ENST00000502676 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.32□□□□□ -1.4
PITX1-202ENST00000502676 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.15□□□□□ -1.42
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.04□□□□□ -1.44
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.02□□□□□ -1.45
PITX1-202ENST00000502676 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PITX1-202ENST00000502676 SVIPQ8NHG7 77 aa5.94□□□□□ -1.46
PITX1-202ENST00000502676 MUC5ACP98088 5654 aa5.93□□□□□ -1.46
PITX1-202ENST00000502676 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PITX1-202ENST00000502676 LCE1EQ5T753 118 aa5.87□□□□□ -1.47
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PITX1-202ENST00000502676 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.56□□□□□ -1.52
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.51□□□□□ -1.53
PITX1-202ENST00000502676 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.49□□□□□ -1.53
PITX1-202ENST00000502676 LCE1CQ5T751 118 aa5.44□□□□□ -1.54
PITX1-202ENST00000502676 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.2□□□□□ -1.58
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.96□□□□□ -1.62
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.91□□□□□ -1.62
PITX1-202ENST00000502676 LCE1FQ5T754 118 aa4.73□□□□□ -1.65
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.6□□□□□ -1.67
PITX1-202ENST00000502676 NDUFAF8A1L188 74 aa4.57□□□□□ -1.68
PITX1-202ENST00000502676 PHGR1C9JFL3 82 aa4.23□□□□□ -1.73
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.22□□□□□ -1.73
PITX1-202ENST00000502676 PRM1P04553 51 aa4.02□□□□□ -1.77
PITX1-202ENST00000502676 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.85□□□□□ -1.79
PITX1-202ENST00000502676 A0A0A0MQY5 61 aa3.69□□□□□ -1.82
PITX1-202ENST00000502676 INE1O15225 51 aa3.68□□□□□ -1.82
PITX1-202ENST00000502676 H3BS24 57 aa3.66□□□□□ -1.82
PITX1-202ENST00000502676 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.14□□□□□ -1.91
PITX1-202ENST00000502676 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.74□□□□□ -1.97
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