RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.13□□□□□ -1.59
CHTF18-212ENST00000493715 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.11□□□□□ -1.59
CHTF18-212ENST00000493715 MT1EP04732 61 aa5.1□□□□□ -1.59
CHTF18-212ENST00000493715 MT4P47944 62 aa5.1□□□□□ -1.59
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.09□□□□□ -1.59
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CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.07□□□□□ -1.6
CHTF18-212ENST00000493715 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.07□□□□□ -1.6
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CHTF18-212ENST00000493715 PP632Q6XCG6 107 aa4.93□□□□□ -1.62
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CHTF18-212ENST00000493715 LCE3AQ5TA76 89 aa4.88□□□□□ -1.63
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CHTF18-212ENST00000493715 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.81□□□□□ -1.64
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.78□□□□□ -1.64
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.76□□□□□ -1.65
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CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.65□□□□□ -1.67
CHTF18-212ENST00000493715 PRO0628Q9UI54 55 aa4.65□□□□□ -1.67
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CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.52□□□□□ -1.69
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CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.48□□□□□ -1.69
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CHTF18-212ENST00000493715 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.41□□□□□ -1.7
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CHTF18-212ENST00000493715 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.37□□□□□ -1.71
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.36□□□□□ -1.71
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CHTF18-212ENST00000493715 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
CHTF18-212ENST00000493715 MUC5ACP98088 5654 aa4.28□□□□□ -1.72
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP5-8O75690 187 aa4.23□□□□□ -1.73
CHTF18-212ENST00000493715 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.17□□□□□ -1.74
CHTF18-212ENST00000493715 MT1AP04731 61 aa4.13□□□□□ -1.75
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.13□□□□□ -1.75
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.12□□□□□ -1.75
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.12□□□□□ -1.75
CHTF18-212ENST00000493715 SVIPQ8NHG7 77 aa4.09□□□□□ -1.75
CHTF18-212ENST00000493715 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.01□□□□□ -1.77
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.99□□□□□ -1.77
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.94□□□□□ -1.78
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.83□□□□□ -1.8
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CHTF18-212ENST00000493715 LUZP6Q538Z0 58 aa3.65□□□□□ -1.83
CHTF18-212ENST00000493715 LCE1EQ5T753 118 aa3.51□□□□□ -1.85
CHTF18-212ENST00000493715 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.37□□□□□ -1.87
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.34□□□□□ -1.87
CHTF18-212ENST00000493715 NDUFAF8A1L188 74 aa3.29□□□□□ -1.88
CHTF18-212ENST00000493715 LCE1CQ5T751 118 aa3.25□□□□□ -1.89
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.22□□□□□ -1.89
CHTF18-212ENST00000493715 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.21□□□□□ -1.9
CHTF18-212ENST00000493715 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.08□□□□□ -1.92
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.06□□□□□ -1.92
CHTF18-212ENST00000493715 LCE1FQ5T754 118 aa3.04□□□□□ -1.92
CHTF18-212ENST00000493715 PHGR1C9JFL3 82 aa3.01□□□□□ -1.93
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
CHTF18-212ENST00000493715 H3BS24 57 aa2.84□□□□□ -1.95
CHTF18-212ENST00000493715 A0A0A0MQY5 61 aa2.83□□□□□ -1.96
CHTF18-212ENST00000493715 INE1O15225 51 aa2.72□□□□□ -1.97
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.72□□□□□ -1.97
CHTF18-212ENST00000493715 PRM1P04553 51 aa2.51□□□□□ -2.01
CHTF18-212ENST00000493715 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.5□□□□□ -2.01
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.5□□□□□ -2.01
CHTF18-212ENST00000493715 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.29□□□□□ -2.04
CHTF18-212ENST00000493715 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 648.7 ms