RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490240.5

MDK-210, Transcript of midkine, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MDK, Length 603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-210ENST00000490240 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.01□□□□□ -1.29
MDK-210ENST00000490240 PMAIP1Q13794 54 aa7.01□□□□□ -1.29
MDK-210ENST00000490240 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.01□□□□□ -1.29
MDK-210ENST00000490240 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.98□□□□□ -1.29
MDK-210ENST00000490240 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.98□□□□□ -1.29
MDK-210ENST00000490240 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.95□□□□□ -1.3
MDK-210ENST00000490240 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.93□□□□□ -1.3
MDK-210ENST00000490240 MT1EP04732 61 aa6.92□□□□□ -1.3
MDK-210ENST00000490240 LCE4AQ5TA78 99 aa6.88□□□□□ -1.31
MDK-210ENST00000490240 MT4P47944 62 aa6.87□□□□□ -1.31
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.8□□□□□ -1.32
MDK-210ENST00000490240 ROMO1P60602 79 aa6.79□□□□□ -1.32
MDK-210ENST00000490240 MT1GP13640 62 aa6.75□□□□□ -1.33
MDK-210ENST00000490240 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.74□□□□□ -1.33
MDK-210ENST00000490240 PP632Q6XCG6 107 aa6.72□□□□□ -1.33
MDK-210ENST00000490240 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.67□□□□□ -1.34
MDK-210ENST00000490240 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.66□□□□□ -1.34
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.64□□□□□ -1.35
MDK-210ENST00000490240 MT1MQ8N339 61 aa6.63□□□□□ -1.35
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.62□□□□□ -1.35
MDK-210ENST00000490240 SVIPQ8NHG7 77 aa6.61□□□□□ -1.35
MDK-210ENST00000490240 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.61□□□□□ -1.35
MDK-210ENST00000490240 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.56□□□□□ -1.36
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.52□□□□□ -1.37
MDK-210ENST00000490240 MT1LQ93083 61 aa6.52□□□□□ -1.37
MDK-210ENST00000490240 TNP1P09430 55 aa6.5□□□□□ -1.37
MDK-210ENST00000490240 PRAC1Q96KF2 57 aa6.5□□□□□ -1.37
MDK-210ENST00000490240 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.48□□□□□ -1.37
MDK-210ENST00000490240 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.4□□□□□ -1.38
MDK-210ENST00000490240 LCE3AQ5TA76 89 aa6.39□□□□□ -1.39
MDK-210ENST00000490240 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.35□□□□□ -1.39
MDK-210ENST00000490240 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.31□□□□□ -1.4
MDK-210ENST00000490240 KRTAP12-3P60328 96 aa6.17□□□□□ -1.42
MDK-210ENST00000490240 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.16□□□□□ -1.42
MDK-210ENST00000490240 KRTAP12-4P60329 112 aa6.13□□□□□ -1.43
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
MDK-210ENST00000490240 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
MDK-210ENST00000490240 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.9□□□□□ -1.46
MDK-210ENST00000490240 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.9□□□□□ -1.46
MDK-210ENST00000490240 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
MDK-210ENST00000490240 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.86□□□□□ -1.47
MDK-210ENST00000490240 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.86□□□□□ -1.47
MDK-210ENST00000490240 MUC5ACP98088 5654 aa5.82□□□□□ -1.48
MDK-210ENST00000490240 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.72□□□□□ -1.49
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-8O75690 187 aa5.7□□□□□ -1.5
MDK-210ENST00000490240 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.67□□□□□ -1.5
MDK-210ENST00000490240 MT1AP04731 61 aa5.54□□□□□ -1.52
MDK-210ENST00000490240 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.53□□□□□ -1.52
MDK-210ENST00000490240 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.53□□□□□ -1.52
MDK-210ENST00000490240 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.52□□□□□ -1.53
MDK-210ENST00000490240 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.41□□□□□ -1.54
MDK-210ENST00000490240 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.41□□□□□ -1.54
MDK-210ENST00000490240 LUZP6Q538Z0 58 aa5.39□□□□□ -1.55
MDK-210ENST00000490240 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.3□□□□□ -1.56
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.23□□□□□ -1.57
MDK-210ENST00000490240 NDUFAF8A1L188 74 aa5.17□□□□□ -1.58
MDK-210ENST00000490240 MT3P25713 68 aa5.12□□□□□ -1.59
MDK-210ENST00000490240 LCE1EQ5T753 118 aa4.82□□□□□ -1.64
MDK-210ENST00000490240 A0A0A0MQY5 61 aa4.62□□□□□ -1.67
MDK-210ENST00000490240 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.6□□□□□ -1.67
MDK-210ENST00000490240 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.58□□□□□ -1.68
MDK-210ENST00000490240 H3BS24 57 aa4.47□□□□□ -1.69
MDK-210ENST00000490240 LCE1CQ5T751 118 aa4.47□□□□□ -1.69
MDK-210ENST00000490240 INE1O15225 51 aa4.39□□□□□ -1.71
MDK-210ENST00000490240 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.36□□□□□ -1.71
MDK-210ENST00000490240 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.18□□□□□ -1.74
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.17□□□□□ -1.74
MDK-210ENST00000490240 LCE1FQ5T754 118 aa4.12□□□□□ -1.75
MDK-210ENST00000490240 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.08□□□□□ -1.76
MDK-210ENST00000490240 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
MDK-210ENST00000490240 PHGR1C9JFL3 82 aa3.99□□□□□ -1.77
MDK-210ENST00000490240 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.65□□□□□ -1.83
MDK-210ENST00000490240 PRM1P04553 51 aa3.5□□□□□ -1.85
MDK-210ENST00000490240 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.45□□□□□ -1.86
MDK-210ENST00000490240 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.43□□□□□ -1.86
MDK-210ENST00000490240 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.05□□□□□ -1.92
MDK-210ENST00000490240 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.35□□□□□ -2.03
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