RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.34	□□□□□ -1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.34	□□□□□ -1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1G	P13640	62 aa		6.31	□□□□□ -1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.3	□□□□□ -1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.29	□□□□□ -1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ROMO1	P60602	79 aa		6.17	□□□□□ -1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.16	□□□□□ -1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.15	□□□□□ -1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1L	Q93083	61 aa		6.14	□□□□□ -1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.13	□□□□□ -1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1M	Q8N339	61 aa		6.12	□□□□□ -1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.11	□□□□□ -1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.07	□□□□□ -1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	MT4	P47944	62 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.94	□□□□□ -1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.94	□□□□□ -1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.91	□□□□□ -1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.89	□□□□□ -1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.84	□□□□□ -1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.83	□□□□□ -1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.78	□□□□□ -1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.69	□□□□□ -1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.67	□□□□□ -1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.66	□□□□□ -1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.62	□□□□□ -1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.55	□□□□□ -1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.55	□□□□□ -1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.51	□□□□□ -1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.46	□□□□□ -1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.45	□□□□□ -1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.43	□□□□□ -1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.39	□□□□□ -1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1A	P04731	61 aa		5.25	□□□□□ -1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.09	□□□□□ -1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MT3	P25713	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HDAC10-216	ENST00000489424	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HDAC10-216	ENST00000489424	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.84	□□□□□ -1.79
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.77	□□□□□ -1.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0A0MQY5	61 aa		3.63	□□□□□ -1.83
HDAC10-216	ENST00000489424	INE1	O15225	51 aa		3.47	□□□□□ -1.85
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.43	□□□□□ -1.86
HDAC10-216	ENST00000489424	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.15	□□□□□ -1.91
HDAC10-216	ENST00000489424	PRM1	P04553	51 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BS24	57 aa		3.04	□□□□□ -1.92
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.98	□□□□□ -1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.53	□□□□□ -2
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.1	□□□□□ -2.07

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