RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484349.1

CHTF18-210, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-210ENST00000484349 LCE3AQ5TA76 89 aa6.71□□□□□ -1.34
CHTF18-210ENST00000484349 MT1GP13640 62 aa6.69□□□□□ -1.34
CHTF18-210ENST00000484349 A6NED7 52 aa6.66□□□□□ -1.34
CHTF18-210ENST00000484349 PP632Q6XCG6 107 aa6.64□□□□□ -1.35
CHTF18-210ENST00000484349 MT1LQ93083 61 aa6.61□□□□□ -1.35
CHTF18-210ENST00000484349 K7ERS5 55 aa6.58□□□□□ -1.36
CHTF18-210ENST00000484349 MT1MQ8N339 61 aa6.57□□□□□ -1.36
CHTF18-210ENST00000484349 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.56□□□□□ -1.36
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP12-3P60328 96 aa6.46□□□□□ -1.38
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.45□□□□□ -1.38
CHTF18-210ENST00000484349 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.45□□□□□ -1.38
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.42□□□□□ -1.38
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.41□□□□□ -1.38
CHTF18-210ENST00000484349 LCE4AQ5TA78 99 aa6.32□□□□□ -1.4
CHTF18-210ENST00000484349 LCE1DQ5T752 114 aa6.29□□□□□ -1.4
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.29□□□□□ -1.4
CHTF18-210ENST00000484349 BRK1Q8WUW1 75 aa6.25□□□□□ -1.41
CHTF18-210ENST00000484349 MT4P47944 62 aa6.23□□□□□ -1.41
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.22□□□□□ -1.41
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.2□□□□□ -1.42
CHTF18-210ENST00000484349 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.16□□□□□ -1.42
CHTF18-210ENST00000484349 ROMO1P60602 79 aa6.15□□□□□ -1.42
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.12□□□□□ -1.43
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.08□□□□□ -1.44
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.05□□□□□ -1.44
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CHTF18-210ENST00000484349 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.96□□□□□ -1.46
CHTF18-210ENST00000484349 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.95□□□□□ -1.46
CHTF18-210ENST00000484349 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.94□□□□□ -1.46
CHTF18-210ENST00000484349 PMAIP1Q13794 54 aa5.93□□□□□ -1.46
CHTF18-210ENST00000484349 PRO0628Q9UI54 55 aa5.91□□□□□ -1.46
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.86□□□□□ -1.47
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP12-4P60329 112 aa5.85□□□□□ -1.47
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.85□□□□□ -1.47
CHTF18-210ENST00000484349 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.84□□□□□ -1.47
CHTF18-210ENST00000484349 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.69□□□□□ -1.5
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.68□□□□□ -1.5
CHTF18-210ENST00000484349 MT1AP04731 61 aa5.63□□□□□ -1.51
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.61□□□□□ -1.51
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.59□□□□□ -1.51
CHTF18-210ENST00000484349 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.52□□□□□ -1.53
CHTF18-210ENST00000484349 PRAC1Q96KF2 57 aa5.51□□□□□ -1.53
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.45□□□□□ -1.54
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.45□□□□□ -1.54
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.33□□□□□ -1.56
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.32□□□□□ -1.56
CHTF18-210ENST00000484349 SVIPQ8NHG7 77 aa5.26□□□□□ -1.57
CHTF18-210ENST00000484349 MT3P25713 68 aa5.16□□□□□ -1.58
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-8O75690 187 aa5.14□□□□□ -1.59
CHTF18-210ENST00000484349 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.12□□□□□ -1.59
CHTF18-210ENST00000484349 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CHTF18-210ENST00000484349 MUC5ACP98088 5654 aa4.98□□□□□ -1.61
CHTF18-210ENST00000484349 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.87□□□□□ -1.63
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.87□□□□□ -1.63
CHTF18-210ENST00000484349 LUZP6Q538Z0 58 aa4.71□□□□□ -1.66
CHTF18-210ENST00000484349 LCE1EQ5T753 118 aa4.71□□□□□ -1.66
CHTF18-210ENST00000484349 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.43□□□□□ -1.7
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.43□□□□□ -1.7
CHTF18-210ENST00000484349 LCE1CQ5T751 118 aa4.37□□□□□ -1.71
CHTF18-210ENST00000484349 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.32□□□□□ -1.72
CHTF18-210ENST00000484349 NDUFAF8A1L188 74 aa4.19□□□□□ -1.74
CHTF18-210ENST00000484349 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.08□□□□□ -1.76
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.99□□□□□ -1.77
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.94□□□□□ -1.78
CHTF18-210ENST00000484349 LCE1FQ5T754 118 aa3.82□□□□□ -1.8
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.68□□□□□ -1.82
CHTF18-210ENST00000484349 A0A0A0MQY5 61 aa3.65□□□□□ -1.83
CHTF18-210ENST00000484349 INE1O15225 51 aa3.51□□□□□ -1.85
CHTF18-210ENST00000484349 PHGR1C9JFL3 82 aa3.4□□□□□ -1.87
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.36□□□□□ -1.87
CHTF18-210ENST00000484349 PRM1P04553 51 aa3.15□□□□□ -1.91
CHTF18-210ENST00000484349 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.13□□□□□ -1.91
CHTF18-210ENST00000484349 H3BS24 57 aa2.91□□□□□ -1.94
CHTF18-210ENST00000484349 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.57□□□□□ -2
CHTF18-210ENST00000484349 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.21□□□□□ -2.06
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