RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE3AQ5TA76 89 aa7.02□□□□□ -1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 MT1GP13640 62 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PP632Q6XCG6 107 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 MT1LQ93083 61 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 MT1MQ8N339 61 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP12-3P60328 96 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 BRK1Q8WUW1 75 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ROMO1P60602 79 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE4AQ5TA78 99 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE1DQ5T752 114 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-209ENST00000484097 MT4P47944 62 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-209ENST00000484097 PMAIP1Q13794 54 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-209ENST00000484097 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PRO0628Q9UI54 55 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP12-4P60329 112 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-209ENST00000484097 PRAC1Q96KF2 57 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-209ENST00000484097 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP4-209ENST00000484097 MT1AP04731 61 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SVIPQ8NHG7 77 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 MT3P25713 68 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-8O75690 187 aa5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4-209ENST00000484097 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4-209ENST00000484097 LUZP6Q538Z0 58 aa4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC5ACP98088 5654 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE1EQ5T753 118 aa4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE1CQ5T751 118 aa4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFAF8A1L188 74 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.07□□□□□ -1.76
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE1FQ5T754 118 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0A0MQY5 61 aa3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4-209ENST00000484097 INE1O15225 51 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4-209ENST00000484097 PHGR1C9JFL3 82 aa3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4-209ENST00000484097 PRM1P04553 51 aa3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4-209ENST00000484097 H3BS24 57 aa2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.62□□□□□ -1.99
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.32□□□□□ -2.04
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