RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PCP4P48539 62 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-211ENST00000480301 K7ERS5 55 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-211ENST00000480301 PP632Q6XCG6 107 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-211ENST00000480301 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ACTB-211ENST00000480301 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-211ENST00000480301 MT1MQ8N339 61 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-211ENST00000480301 A6NED7 52 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP12-3P60328 96 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-211ENST00000480301 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-211ENST00000480301 LCE4AQ5TA78 99 aa7.03□□□□□ -1.28
ACTB-211ENST00000480301 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.03□□□□□ -1.28
ACTB-211ENST00000480301 ROMO1P60602 79 aa7.01□□□□□ -1.29
ACTB-211ENST00000480301 LCE1DQ5T752 114 aa6.98□□□□□ -1.29
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.96□□□□□ -1.3
ACTB-211ENST00000480301 MT4P47944 62 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-211ENST00000480301 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.82□□□□□ -1.32
ACTB-211ENST00000480301 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-211ENST00000480301 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-211ENST00000480301 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP12-4P60329 112 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-211ENST00000480301 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ACTB-211ENST00000480301 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-211ENST00000480301 BRK1Q8WUW1 75 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.42□□□□□ -1.38
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.39□□□□□ -1.39
ACTB-211ENST00000480301 MT1AP04731 61 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.14□□□□□ -1.43
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.13□□□□□ -1.43
ACTB-211ENST00000480301 PMAIP1Q13794 54 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-211ENST00000480301 PRAC1Q96KF2 57 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-211ENST00000480301 MT3P25713 68 aa5.81□□□□□ -1.48
ACTB-211ENST00000480301 PRO0628Q9UI54 55 aa5.78□□□□□ -1.48
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-8O75690 187 aa5.73□□□□□ -1.49
ACTB-211ENST00000480301 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.63□□□□□ -1.51
ACTB-211ENST00000480301 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.49□□□□□ -1.53
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.46□□□□□ -1.54
ACTB-211ENST00000480301 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.36□□□□□ -1.55
ACTB-211ENST00000480301 MUC5ACP98088 5654 aa5.35□□□□□ -1.55
ACTB-211ENST00000480301 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
ACTB-211ENST00000480301 LCE1EQ5T753 118 aa5.29□□□□□ -1.56
ACTB-211ENST00000480301 SVIPQ8NHG7 77 aa5.22□□□□□ -1.57
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5□□□□□ -1.61
ACTB-211ENST00000480301 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.95□□□□□ -1.62
ACTB-211ENST00000480301 LCE1CQ5T751 118 aa4.91□□□□□ -1.62
ACTB-211ENST00000480301 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.91□□□□□ -1.62
ACTB-211ENST00000480301 LUZP6Q538Z0 58 aa4.89□□□□□ -1.63
ACTB-211ENST00000480301 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.66□□□□□ -1.66
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.45□□□□□ -1.7
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.43□□□□□ -1.7
ACTB-211ENST00000480301 LCE1FQ5T754 118 aa4.26□□□□□ -1.73
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.17□□□□□ -1.74
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF8A1L188 74 aa4.07□□□□□ -1.76
ACTB-211ENST00000480301 PHGR1C9JFL3 82 aa3.82□□□□□ -1.8
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.78□□□□□ -1.8
ACTB-211ENST00000480301 PRM1P04553 51 aa3.6□□□□□ -1.83
ACTB-211ENST00000480301 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.48□□□□□ -1.85
ACTB-211ENST00000480301 H3BS24 57 aa3.3□□□□□ -1.88
ACTB-211ENST00000480301 INE1O15225 51 aa3.28□□□□□ -1.88
ACTB-211ENST00000480301 A0A0A0MQY5 61 aa3.22□□□□□ -1.89
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.8□□□□□ -1.96
ACTB-211ENST00000480301 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.44□□□□□ -2.02
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