RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SFI1-222	ENST00000478887	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SFI1-222	ENST00000478887	NEB	P20929	6669 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SFI1-222	ENST00000478887	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SFI1-222	ENST00000478887	TNP1	P09430	55 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SFI1-222	ENST00000478887		A6NED7	52 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SFI1-222	ENST00000478887		K7ERS5	55 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SFI1-222	ENST00000478887	MT1E	P04732	61 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SFI1-222	ENST00000478887	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SFI1-222	ENST00000478887	SPRR2D	P22532	72 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SFI1-222	ENST00000478887	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SFI1-222	ENST00000478887	MT1L	Q93083	61 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SFI1-222	ENST00000478887	MT1G	P13640	62 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SFI1-222	ENST00000478887	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SFI1-222	ENST00000478887	MT1M	Q8N339	61 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SFI1-222	ENST00000478887	ROMO1	P60602	79 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SFI1-222	ENST00000478887	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SFI1-222	ENST00000478887	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SFI1-222	ENST00000478887	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SFI1-222	ENST00000478887	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SFI1-222	ENST00000478887	MT4	P47944	62 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFI1-222	ENST00000478887	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFI1-222	ENST00000478887	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3	□□□□□ -1.93
SFI1-222	ENST00000478887	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SFI1-222	ENST00000478887	MT3	P25713	68 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SFI1-222	ENST00000478887	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP12-4	P60329	112 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SFI1-222	ENST00000478887	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SFI1-222	ENST00000478887	MT1A	P04731	61 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SFI1-222	ENST00000478887	PRAC1	Q96KF2	57 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SFI1-222	ENST00000478887	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SFI1-222	ENST00000478887		A0A0A0MQY5	61 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SFI1-222	ENST00000478887	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SFI1-222	ENST00000478887	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SFI1-222	ENST00000478887	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SFI1-222	ENST00000478887	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.56	□□□□□ -2
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.53	□□□□□ -2
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SFI1-222	ENST00000478887	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.41	□□□□□ -2.02
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SFI1-222	ENST00000478887	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SFI1-222	ENST00000478887	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.31	□□□□□ -2.04
SFI1-222	ENST00000478887	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
SFI1-222	ENST00000478887	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SFI1-222	ENST00000478887	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SFI1-222	ENST00000478887	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SFI1-222	ENST00000478887	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SFI1-222	ENST00000478887	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.89	□□□□□ -2.11
SFI1-222	ENST00000478887	INE1	O15225	51 aa		1.8	□□□□□ -2.12
SFI1-222	ENST00000478887	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.71	□□□□□ -2.14
SFI1-222	ENST00000478887	PRM1	P04553	51 aa		1.7	□□□□□ -2.14
SFI1-222	ENST00000478887	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.61	□□□□□ -2.15
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.22	□□□□□ -2.21
SFI1-222	ENST00000478887	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.13	□□□□□ -2.23

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