RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HDAC10-208	ENST00000470965	MT1G	P13640	62 aa		7.18	□□□□□ -1.26
HDAC10-208	ENST00000470965	PP632	Q6XCG6	107 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDAC10-208	ENST00000470965	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		7.13	□□□□□ -1.27
HDAC10-208	ENST00000470965	MT1L	Q93083	61 aa		7.12	□□□□□ -1.27
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.08	□□□□□ -1.28
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.04	□□□□□ -1.28
HDAC10-208	ENST00000470965	MT1M	Q8N339	61 aa		7.02	□□□□□ -1.29
HDAC10-208	ENST00000470965	ROMO1	P60602	79 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HDAC10-208	ENST00000470965	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.83	□□□□□ -1.32
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.77	□□□□□ -1.33
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.73	□□□□□ -1.33
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.71	□□□□□ -1.34
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.64	□□□□□ -1.35
HDAC10-208	ENST00000470965	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.64	□□□□□ -1.35
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.54	□□□□□ -1.36
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.54	□□□□□ -1.36
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.49	□□□□□ -1.37
HDAC10-208	ENST00000470965	MT4	P47944	62 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
HDAC10-208	ENST00000470965	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.35	□□□□□ -1.39
HDAC10-208	ENST00000470965	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.35	□□□□□ -1.39
HDAC10-208	ENST00000470965	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.33	□□□□□ -1.4
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.29	□□□□□ -1.4
HDAC10-208	ENST00000470965	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.28	□□□□□ -1.4
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.21	□□□□□ -1.42
HDAC10-208	ENST00000470965	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.19	□□□□□ -1.42
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.14	□□□□□ -1.43
HDAC10-208	ENST00000470965	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.12	□□□□□ -1.43
HDAC10-208	ENST00000470965	MT1A	P04731	61 aa		6.08	□□□□□ -1.44
HDAC10-208	ENST00000470965	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HDAC10-208	ENST00000470965	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.95	□□□□□ -1.46
HDAC10-208	ENST00000470965	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.92	□□□□□ -1.46
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.9	□□□□□ -1.46
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.83	□□□□□ -1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDAC10-208	ENST00000470965	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.66	□□□□□ -1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.65	□□□□□ -1.5
HDAC10-208	ENST00000470965	MT3	P25713	68 aa		5.57	□□□□□ -1.52
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.54	□□□□□ -1.52
HDAC10-208	ENST00000470965	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.43	□□□□□ -1.54
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.34	□□□□□ -1.55
HDAC10-208	ENST00000470965	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.29	□□□□□ -1.56
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.12	□□□□□ -1.59
HDAC10-208	ENST00000470965	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HDAC10-208	ENST00000470965	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDAC10-208	ENST00000470965	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDAC10-208	ENST00000470965	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
HDAC10-208	ENST00000470965	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HDAC10-208	ENST00000470965	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HDAC10-208	ENST00000470965	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.62	□□□□□ -1.83
HDAC10-208	ENST00000470965		A0A0A0MQY5	61 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HDAC10-208	ENST00000470965	PRM1	P04553	51 aa		3.55	□□□□□ -1.84
HDAC10-208	ENST00000470965	INE1	O15225	51 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.51	□□□□□ -1.85
HDAC10-208	ENST00000470965		H3BS24	57 aa		3.47	□□□□□ -1.85
HDAC10-208	ENST00000470965	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.26	□□□□□ -1.89
HDAC10-208	ENST00000470965	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.63	□□□□□ -1.99
HDAC10-208	ENST00000470965	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.39	□□□□□ -2.03

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