RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRR15L	Q9BU68	103 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		7.17	□□□□□ -1.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	UQCR11	O14957	56 aa		7.15	□□□□□ -1.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMEM258	P61165	79 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		7	□□□□□ -1.29
PRKCZ-208	ENST00000468310	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCZ-208	ENST00000468310	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PRKCZ-208	ENST00000468310		K7ERS5	55 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PRKCZ-208	ENST00000468310	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.9	□□□□□ -1.3
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.82	□□□□□ -1.32
PRKCZ-208	ENST00000468310	PSPHP1	O15172	72 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.72	□□□□□ -1.33
PRKCZ-208	ENST00000468310		V9GYY9	64 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PRKCZ-208	ENST00000468310	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
PRKCZ-208	ENST00000468310	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PRKCZ-208	ENST00000468310	PCP4	P48539	62 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKCZ-208	ENST00000468310		Q1T7F1	81 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PRKCZ-208	ENST00000468310		A6NED7	52 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PRKCZ-208	ENST00000468310	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PRKCZ-208	ENST00000468310	MT1A	P04731	61 aa		6.49	□□□□□ -1.37
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.44	□□□□□ -1.38
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.43	□□□□□ -1.38
PRKCZ-208	ENST00000468310	ROMO1	P60602	79 aa		6.37	□□□□□ -1.39
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-8	O75690	187 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PRKCZ-208	ENST00000468310	MUC5AC	P98088	5654 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PRKCZ-208	ENST00000468310	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PRKCZ-208	ENST00000468310	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PRKCZ-208	ENST00000468310	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PRKCZ-208	ENST00000468310	MT3	P25713	68 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PRKCZ-208	ENST00000468310	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PRKCZ-208	ENST00000468310	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PRKCZ-208	ENST00000468310	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PRKCZ-208	ENST00000468310	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRKCZ-208	ENST00000468310	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRKCZ-208	ENST00000468310	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCZ-208	ENST00000468310	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRKCZ-208	ENST00000468310	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-208	ENST00000468310	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-208	ENST00000468310	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRKCZ-208	ENST00000468310	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PRKCZ-208	ENST00000468310	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.96	□□□□□ -1.78
PRKCZ-208	ENST00000468310	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PRKCZ-208	ENST00000468310	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PRKCZ-208	ENST00000468310		H3BS24	57 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRM1	P04553	51 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRKCZ-208	ENST00000468310	INE1	O15225	51 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A0A0MQY5	61 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PRKCZ-208	ENST00000468310	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.64	□□□□□ -1.99

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