RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MT1G	P13640	62 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MT1L	Q93083	61 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MT1M	Q8N339	61 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ROMO1	P60602	79 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MT4	P47944	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MT1A	P04731	61 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MT3	P25713	68 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRM1	P04553	51 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	INE1	O15225	51 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A0A0MQY5	61 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.46	□□□□□ -2.02
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		H3BS24	57 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.99	□□□□□ -2.09
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.81	□□□□□ -2.12

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