RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463189.1

TTC31-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 31, human

TSL 3

Gene TTC31, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC31-208	ENST00000463189	ROMO1	P60602	79 aa		6.32	□□□□□ -1.4
TTC31-208	ENST00000463189	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTC31-208	ENST00000463189	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTC31-208	ENST00000463189	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC31-208	ENST00000463189	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC31-208	ENST00000463189	TNP1	P09430	55 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC31-208	ENST00000463189	MT1E	P04732	61 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC31-208	ENST00000463189	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC31-208	ENST00000463189	PRAC1	Q96KF2	57 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTC31-208	ENST00000463189	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC31-208	ENST00000463189	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC31-208	ENST00000463189	MT4	P47944	62 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTC31-208	ENST00000463189	MT1G	P13640	62 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC31-208	ENST00000463189	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTC31-208	ENST00000463189	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTC31-208	ENST00000463189	MT1M	Q8N339	61 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC31-208	ENST00000463189	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC31-208	ENST00000463189	MT1L	Q93083	61 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC31-208	ENST00000463189	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TTC31-208	ENST00000463189	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC31-208	ENST00000463189	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC31-208	ENST00000463189	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TTC31-208	ENST00000463189	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC31-208	ENST00000463189	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC31-208	ENST00000463189	MT1A	P04731	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC31-208	ENST00000463189	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC31-208	ENST00000463189	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC31-208	ENST00000463189	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTC31-208	ENST00000463189	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTC31-208	ENST00000463189	MT3	P25713	68 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TTC31-208	ENST00000463189		H3BS24	57 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC31-208	ENST00000463189		A0A0A0MQY5	61 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TTC31-208	ENST00000463189	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TTC31-208	ENST00000463189	INE1	O15225	51 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TTC31-208	ENST00000463189	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TTC31-208	ENST00000463189	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TTC31-208	ENST00000463189	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TTC31-208	ENST00000463189	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC31-208	ENST00000463189	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TTC31-208	ENST00000463189	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TTC31-208	ENST00000463189	PRM1	P04553	51 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TTC31-208	ENST00000463189	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTC31-208	ENST00000463189	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.62	□□□□□ -1.99
TTC31-208	ENST00000463189	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.03	□□□□□ -2.08

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