RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457264.5

MRPL55-222, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 3

Gene MRPL55, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-222	ENST00000457264	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.61	□□□□□ -1.51
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MRPL55-222	ENST00000457264	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MRPL55-222	ENST00000457264		A8MU10	97 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MRPL55-222	ENST00000457264		A0A1B0GU69	56 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MRPL55-222	ENST00000457264	COX7C	P15954	63 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MRPL55-222	ENST00000457264	PCP4	P48539	62 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL55-222	ENST00000457264		H7BZZ5	65 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MRPL55-222	ENST00000457264	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL55-222	ENST00000457264	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MRPL55-222	ENST00000457264	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MRPL55-222	ENST00000457264	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL55-222	ENST00000457264	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPL55-222	ENST00000457264	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MRPL55-222	ENST00000457264	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MRPL55-222	ENST00000457264	UQCR11	O14957	56 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPL55-222	ENST00000457264	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPL55-222	ENST00000457264	MT1A	P04731	61 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPL55-222	ENST00000457264	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPL55-222	ENST00000457264	TMEM258	P61165	79 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL55-222	ENST00000457264	MUC5AC	P98088	5654 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPL55-222	ENST00000457264	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL55-222	ENST00000457264	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL55-222	ENST00000457264		K7ERS5	55 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL55-222	ENST00000457264	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL55-222	ENST00000457264	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL55-222	ENST00000457264	PSPHP1	O15172	72 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL55-222	ENST00000457264		Q1T7F1	81 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL55-222	ENST00000457264		V9GYY9	64 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL55-222	ENST00000457264	MT3	P25713	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL55-222	ENST00000457264		A6NED7	52 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL55-222	ENST00000457264	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL55-222	ENST00000457264	ROMO1	P60602	79 aa		4.45	□□□□□ -1.7
MRPL55-222	ENST00000457264	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MRPL55-222	ENST00000457264	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.39	□□□□□ -1.71
MRPL55-222	ENST00000457264	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRPL55-222	ENST00000457264	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.32	□□□□□ -1.72
MRPL55-222	ENST00000457264	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL55-222	ENST00000457264	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL55-222	ENST00000457264	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL55-222	ENST00000457264	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL55-222	ENST00000457264	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MRPL55-222	ENST00000457264	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
MRPL55-222	ENST00000457264	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MRPL55-222	ENST00000457264	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.49	□□□□□ -1.85
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL55-222	ENST00000457264	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRPL55-222	ENST00000457264	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRPL55-222	ENST00000457264	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL55-222	ENST00000457264	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRPL55-222	ENST00000457264		H3BS24	57 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MRPL55-222	ENST00000457264		A0A0A0MQY5	61 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MRPL55-222	ENST00000457264	INE1	O15225	51 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MRPL55-222	ENST00000457264	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MRPL55-222	ENST00000457264	PRM1	P04553	51 aa		2.25	□□□□□ -2.05
MRPL55-222	ENST00000457264	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.07	□□□□□ -2.08

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms