RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.73□□□□□ -1.81
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.73□□□□□ -1.81
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0D9SG42 100 aa3.72□□□□□ -1.81
DDX39B-211ENST00000449757 MT1MQ8N339 61 aa3.69□□□□□ -1.82
DDX39B-211ENST00000449757 A6NED7 52 aa3.68□□□□□ -1.82
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GU69 56 aa3.65□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.65□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.65□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.65□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 MT1LQ93083 61 aa3.64□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.64□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.63□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.61□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 SEC61GP60059 68 aa3.6□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 A8MU10 97 aa3.59□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.59□□□□□ -1.83
DDX39B-211ENST00000449757 UQCR11O14957 56 aa3.58□□□□□ -1.84
DDX39B-211ENST00000449757 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.57□□□□□ -1.84
DDX39B-211ENST00000449757 PMAIP1Q13794 54 aa3.57□□□□□ -1.84
DDX39B-211ENST00000449757 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.55□□□□□ -1.84
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.55□□□□□ -1.84
DDX39B-211ENST00000449757 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.55□□□□□ -1.84
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DDX39B-211ENST00000449757 LCE3AQ5TA76 89 aa3.53□□□□□ -1.84
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GU33 70 aa3.5□□□□□ -1.85
DDX39B-211ENST00000449757 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.48□□□□□ -1.85
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DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.47□□□□□ -1.85
DDX39B-211ENST00000449757 TNP1P09430 55 aa3.46□□□□□ -1.86
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.44□□□□□ -1.86
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP12-4P60329 112 aa3.39□□□□□ -1.87
DDX39B-211ENST00000449757 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.38□□□□□ -1.87
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.38□□□□□ -1.87
DDX39B-211ENST00000449757 K7ERS5 55 aa3.38□□□□□ -1.87
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP12-3P60328 96 aa3.38□□□□□ -1.87
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
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DDX39B-211ENST00000449757 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DDX39B-211ENST00000449757 ROMO1P60602 79 aa3.25□□□□□ -1.89
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.22□□□□□ -1.89
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.21□□□□□ -1.9
DDX39B-211ENST00000449757 MUC5ACP98088 5654 aa3.19□□□□□ -1.9
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.19□□□□□ -1.9
DDX39B-211ENST00000449757 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
DDX39B-211ENST00000449757 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-8O75690 187 aa3.12□□□□□ -1.91
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.12□□□□□ -1.91
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.1□□□□□ -1.91
DDX39B-211ENST00000449757 MT1AP04731 61 aa3.09□□□□□ -1.91
DDX39B-211ENST00000449757 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.07□□□□□ -1.92
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.06□□□□□ -1.92
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.04□□□□□ -1.92
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.02□□□□□ -1.93
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3□□□□□ -1.93
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0A0MQY5 61 aa2.97□□□□□ -1.93
DDX39B-211ENST00000449757 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.96□□□□□ -1.94
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.89□□□□□ -1.95
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.85□□□□□ -1.95
DDX39B-211ENST00000449757 MT3P25713 68 aa2.84□□□□□ -1.95
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFAF8A1L188 74 aa2.73□□□□□ -1.97
DDX39B-211ENST00000449757 LUZP6Q538Z0 58 aa2.69□□□□□ -1.98
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.63□□□□□ -1.99
DDX39B-211ENST00000449757 LCE1EQ5T753 118 aa2.62□□□□□ -1.99
DDX39B-211ENST00000449757 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.59□□□□□ -1.99
DDX39B-211ENST00000449757 LCE1CQ5T751 118 aa2.44□□□□□ -2.02
DDX39B-211ENST00000449757 INE1O15225 51 aa2.29□□□□□ -2.04
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.25□□□□□ -2.05
DDX39B-211ENST00000449757 LCE1FQ5T754 118 aa2.22□□□□□ -2.05
DDX39B-211ENST00000449757 PHGR1C9JFL3 82 aa2.21□□□□□ -2.06
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
DDX39B-211ENST00000449757 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.17□□□□□ -2.06
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.01□□□□□ -2.09
DDX39B-211ENST00000449757 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.99□□□□□ -2.09
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.95□□□□□ -2.1
DDX39B-211ENST00000449757 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.85□□□□□ -2.11
DDX39B-211ENST00000449757 PRM1P04553 51 aa1.7□□□□□ -2.14
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.69□□□□□ -2.14
DDX39B-211ENST00000449757 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.34□□□□□ -2.19
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