RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A6NED7 52 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MT1GP13640 62 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MT1LQ93083 61 aa9.69□□□□□ -0.86
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PP632Q6XCG6 107 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP12-3P60328 96 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MT1MQ8N339 61 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ROMO1P60602 79 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPR98Q8WXG9 6306 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE4AQ5TA78 99 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE1DQ5T752 114 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MT4P47944 62 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BRK1Q8WUW1 75 aa8.83□□□□□ -1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP12-4P60329 112 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PMAIP1Q13794 54 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MT1AP04731 61 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa8.07□□□□□ -1.12
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRAC1Q96KF2 57 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRO0628Q9UI54 55 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.88□□□□□ -1.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.75□□□□□ -1.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.57□□□□□ -1.2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.54□□□□□ -1.2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MT3P25713 68 aa7.52□□□□□ -1.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-8O75690 187 aa7.32□□□□□ -1.24
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OBSCNQ5VST9 7968 aa7.27□□□□□ -1.24
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SVIPQ8NHG7 77 aa7.19□□□□□ -1.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MUC5ACP98088 5654 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa7□□□□□ -1.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE1EQ5T753 118 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LUZP6Q538Z0 58 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE1CQ5T751 118 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.12□□□□□ -1.43
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BS24 57 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.71□□□□□ -1.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NDUFAF8A1L188 74 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE1FQ5T754 118 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PHGR1C9JFL3 82 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.89□□□□□ -1.63
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRM1P04553 51 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A0A0MQY5 61 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INE1O15225 51 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.46□□□□□ -1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.7□□□□□ -1.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MUC16Q8WXI7 14507 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms