RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCP4P48539 62 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT1MQ8N339 61 aa8.83□□□□□ -1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PP632Q6XCG6 107 aa8.82□□□□□ -1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 K7ERS5 55 aa8.8□□□□□ -1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP12-3P60328 96 aa8.73□□□□□ -1.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A6NED7 52 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE4AQ5TA78 99 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE1DQ5T752 114 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ROMO1P60602 79 aa8.32□□□□□ -1.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT4P47944 62 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.14□□□□□ -1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.11□□□□□ -1.11
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.08□□□□□ -1.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.07□□□□□ -1.12
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.9□□□□□ -1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.81□□□□□ -1.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.78□□□□□ -1.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP12-4P60329 112 aa7.76□□□□□ -1.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRK1Q8WUW1 75 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.6□□□□□ -1.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT1AP04731 61 aa7.58□□□□□ -1.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.55□□□□□ -1.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.32□□□□□ -1.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PMAIP1Q13794 54 aa7.24□□□□□ -1.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.16□□□□□ -1.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRAC1Q96KF2 57 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRO0628Q9UI54 55 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT3P25713 68 aa6.9□□□□□ -1.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-8O75690 187 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC5ACP98088 5654 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE1EQ5T753 118 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SVIPQ8NHG7 77 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.97□□□□□ -1.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE1CQ5T751 118 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LUZP6Q538Z0 58 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.35□□□□□ -1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BS24 57 aa5.32□□□□□ -1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE1FQ5T754 118 aa5.06□□□□□ -1.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDUFAF8A1L188 74 aa4.87□□□□□ -1.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHGR1C9JFL3 82 aa4.56□□□□□ -1.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRM1P04553 51 aa4.28□□□□□ -1.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.15□□□□□ -1.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INE1O15225 51 aa4□□□□□ -1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0A0MQY5 61 aa3.99□□□□□ -1.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.34□□□□□ -1.87
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC16Q8WXI7 14507 aa3□□□□□ -1.93
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